EP0528007A1 - NUCLEOTIDIC SEQUENCES CODING FOR VARIABLE REGIONS OF $g(b) CHAINS OF HUMAN T LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDIC SEGMENTS AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS - Google Patents

NUCLEOTIDIC SEQUENCES CODING FOR VARIABLE REGIONS OF $g(b) CHAINS OF HUMAN T LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDIC SEGMENTS AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS

Info

Publication number
EP0528007A1
EP0528007A1 EP92906703A EP92906703A EP0528007A1 EP 0528007 A1 EP0528007 A1 EP 0528007A1 EP 92906703 A EP92906703 A EP 92906703A EP 92906703 A EP92906703 A EP 92906703A EP 0528007 A1 EP0528007 A1 EP 0528007A1
Authority
EP
European Patent Office
Prior art keywords
sequences
seq
leu
ser
gly
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
EP92906703A
Other languages
German (de)
French (fr)
Inventor
Thierry Hercend
Frédéric Triebel
Sergio Roman-Roman
Laurent Ferradini
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Aventis Pharma SA
Original Assignee
Roussel Uclaf SA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FR9101613A external-priority patent/FR2672617B1/en
Priority claimed from FR9104523A external-priority patent/FR2675155A1/en
Application filed by Roussel Uclaf SA filed Critical Roussel Uclaf SA
Publication of EP0528007A1 publication Critical patent/EP0528007A1/en
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1138—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against receptors or cell surface proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/70503—Immunoglobulin superfamily
    • C07K14/7051—T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2809—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against the T-cell receptor (TcR)-CD3 complex
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides

Abstract

La présente invention concerne de nouvelles séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes beta des récepteurs des lymphocytes T humains, les segments peptidiques correspondants et les applications diagnostiques et thérapeutiques.The present invention relates to novel nucleotide sequences coding for variable regions of beta chains of human T lymphocyte receptors, the corresponding peptide segments and diagnostic and therapeutic applications.

Description

Sécfuences nucléotidicrues codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains . seσments peptidiσues correspondants et les applications diagnostiques et thérapeutiques.  Nucleotide microscopic sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors. corresponding peptide segments and diagnostic and therapeutic applications.
La présente invention concerne de nouvelles séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des cellules T, les segments peptidiques correspondants et les applications diagnostiques et thérapeutiques. The present invention relates to new nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of T cell receptors, the corresponding peptide segments and diagnostic and therapeutic applications.
Il est connu que les récepteurs reconnaissant les antigènes à la surface des lymphocytes T matures (désignés ci-après récepteurs des cellules T) possèdent une structure ayant une certaine analogie avec celles des immunoglobulines. Ainsi, ils comprennent des structures hétérodimériques comportant des chaînes glycoprotéiques _ et β ou des chaînes glycoprotéiques γ et S (voir Meuer et al. (1), Moingeon et al. (2), Brenner et al. (3), Bank et al. (4)).  It is known that the receptors recognizing the antigens on the surface of mature T lymphocytes (hereinafter referred to as T cell receptors) have a structure having a certain analogy with those of immunoglobulins. Thus, they include heterodimeric structures comprising _ and β glycoprotein chains or γ and S glycoprotein chains (see Meuer et al. (1), Moingeon et al. (2), Brenner et al. (3), Bank et al . (4)).
Le répertoire des récepteurs des cellules T doit pouvoir faire face à l'immense diversité des déterminants antigéniques. Ceci est obtenu par recombinaison génétique des différents segments discontinus des gènes qui codent pour les différentes régions structurales des récepteurs des cellules T. Ainsi, les gènes comprennent des segments V (segments variables), éventuellement des segments D (segments de diversité), des segments J (segments de jonction) et des segments C (segments constants). Pendant la différenciation des cellules T, des gènes spécifiques sont créés par recombinaison des segments V, D et J pour les locus β et δ et des segments V et J pour les locus α et β . Ces combinaisons spécifiques ainsi que l'appariement des deux chaînes créent la diversité combinatoire. Cette diversité est fortement amplifiée par deux mécanismes supplémentaires, à savoir la réunion imprécise des segments V-D-J ou V-J et l'addition de nucléotides correspondant à la région N (Davis et al. (5)).  The repertoire of T cell receptors must be able to cope with the immense diversity of antigenic determinants. This is obtained by genetic recombination of the different discontinuous segments of the genes which code for the different structural regions of the T-cell receptors. Thus, the genes include V segments (variable segments), possibly D segments (diversity segments), segments J (junction segments) and C segments (constant segments). During the differentiation of T cells, specific genes are created by recombination of the V, D and J segments for the β and δ loci and of the V and J segments for the α and β loci. These specific combinations as well as the pairing of the two chains create combinatorial diversity. This diversity is greatly amplified by two additional mechanisms, namely the imprecise joining of the V-D-J or V-J segments and the addition of nucleotides corresponding to the N region (Davis et al. (5)).
On connaît déjà un certain nombre de segments géniques V. Ces segments ont été groupés en sous-familles en fonction de la similarité des séquences. Par définition, les segments qui présentent plus de 75 % de similarité dans la séquence nucléo- tidique ont été considérés comme des membres de la même sous famille (Crews et al. 6)). Actuellement, on connaît environ 60 segments géniques Vβ distincts (Wilson et al. (7), Robinson (8), Leider et al. (9), Reynolds (10), Li et al. (11)) qui ont été classés en 20 sous-familles dont 7 avec un seul membre (voir Wilson et al. déjà cité). We already know a certain number of V gene segments. These segments have been grouped into subfamilies according to the similarity of the sequences. By definition, the segments which have more than 75% similarity in the nucleotide sequence have been considered to be members of the same subfamily (Crews et al. 6)). Currently, about 60 distinct Vβ gene segments are known (Wilson et al. (7), Robinson (8), Leider et al. (9), Reynolds (10), Li et al. (11)) which have been classified into 20 subfamilies including 7 with a single member (see Wilson et al. Already cited).
On a par ailleurs décrit récemment dans WO 90/06758 des anticorps monoclonaux dirigés contre des segments spécifiques des parties variables des récepteurs des cellules T, notamment des chaînes β et. S . Ces anticorps monoclonaux sont utiles non seulement comme outils de diagnostic mais également comme outils thérapeutiques, par exemple vis-à-vis de l'arthrite rhumatoïde.  Furthermore, WO 90/06758 has recently described monoclonal antibodies directed against specific segments of the variable parts of the T cell receptors, in particular β and chains. S. These monoclonal antibodies are useful not only as diagnostic tools but also as therapeutic tools, for example with respect to rheumatoid arthritis.
On a également décrit l'utilisation de peptides synthéti- ques correspondant à des régions variables des chaînes α ou β dans le traitement des maladies auto-immunes (27 et 28).  The use of synthetic peptides corresponding to variable regions of the α or β chains has also been described in the treatment of autoimmune diseases (27 and 28).
Il est par ailleurs connu qu'il existe des variations d'un individu à un autre dans l'expression des différents segments variables du récepteur T chez l'homme (27 et 28).  It is also known that there are variations from one individual to another in the expression of the different variable segments of the T receptor in humans (27 and 28).
La présente invention vise à enrichir le répertoire des segments géniques codant pour des régions variables des chaînes β des récepteurs des cellules T en fournissant de nouveaux segments géniques Vβ appartenant à des nouvelles sous familles ou appartenant à des sous-familles dont on connaît déjà au moins un membre.  The present invention aims to enrich the repertoire of gene segments coding for variable regions of the β chains of T cell receptors by providing new Vβ gene segments belonging to new subfamilies or belonging to subfamilies of which at least one is already known. a member.
La présente invention a ainsi pour objet des séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains, correspondant à des ADNc comprenant des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 2 à 19, et les séquences qui en diffèrent par un ou plusieurs nucléotides.  The present invention thus relates to nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of receptors for human T lymphocytes, corresponding to cDNAs comprising nucleotide sequences chosen from any of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID Nº 2 to 19, and the sequences which differ from it by one or more nucleotides.
La présente invention a plus particulièrement pour objet des séquences codant pour des régions variables des chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains, correspondant à des ADNc comprenant des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 2 à 5, et les séquences qui en diffèrent par un ou plusieurs nucléotides. The present invention relates more particularly to sequences coding for variable regions of the β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding to cDNAs comprising nucleotide sequences chosen from any of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID No 2 to 5, and the sequences which differ from it by one or more nucleotides.
Par l'expression "et les séquences qui en diffèrent par un ou plusieurs nucléotides", on englobe les allèles qui présentent jusqu'à 8 nucléotides de différence, mais le plus souvent 1 ou 2 nucléotides de différence, ou qui peuvent différer par la délétion ou l'addition d'un ou deux codons.  By the expression "and the sequences which differ from it by one or more nucleotides", we include alleles which have up to 8 nucleotides of difference, but most often 1 or 2 nucleotides of difference, or which can differ by deletion or the addition of one or two codons.
La présente invention a également plus particulièrement pour objet :  A more particular subject of the present invention is also:
- des séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains correspondant à des ADNc correspondant à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences  - nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors corresponding to cDNAs corresponding to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences
SEQ ID Nº 2 à 5, et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides,  SEQ ID Nº 2 to 5, and the sequences which differ by one or two nucleotides,
- des séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains correspondant à des ADNc correspondant à l'une des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 6 à 15, les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides et les fragments de celles-ci, notamment les fragments des séquences qui correspondent à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences  - nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors corresponding to cDNAs corresponding to one of the nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID No 6 to 15, the sequences which differ by one or two nucleotides and the fragments thereof, in particular the fragments of the sequences which correspond to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences
1 à 155 de SEQ ID N° 8  1 to 155 of SEQ ID N ° 8
1 à 125 de SEQ ID N° 9  1 to 125 of SEQ ID N ° 9
l à 111 de SEQ ID N° 10,  l to 111 of SEQ ID N ° 10,
et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides,and the sequences which differ by one or two nucleotides,
- des séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains correspondant à des ADNc correspondant à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences - nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors corresponding to cDNAs corresponding to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences
1 à 195 de SEQ ID N° 16  1 to 195 of SEQ ID N ° 16
1 à 99 de SEQ ID N° 17 1 à 113 de SEQ ID Nº 18 1 to 99 of SEQ ID N ° 17 1 to 113 of SEQ ID Nº 18
1 à 186 de SEQ ID Nº 19,  1 to 186 of SEQ ID Nº 19,
et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides.  and sequences which differ by one or two nucleotides.
Par l'expression "séquences nucléotidiques correspondant à des ADNc correspondant à tout ou partie des séquences nucléotidiques", on désigne aussi bien les séquences complètes que des fragments de ces séquences, y compris des fragments courts qui trouvent des applications en tant que sondes (géné- ralement comportant au moins 10 nucléotides) ou en tant qu'amorce (comportant généralement au moins 15 nucléotides). La présente invention englobe d'une manière générale l'ensemble des nouveaux oligonucléotides qui sont des fragments des séquences Vβ selon l'invention.  The expression “nucleotide sequences corresponding to cDNAs corresponding to all or part of the nucleotide sequences” denotes both the complete sequences and fragments of these sequences, including short fragments which find applications as probes (gene - actually comprising at least 10 nucleotides) or as a primer (generally comprising at least 15 nucleotides). The present invention generally encompasses all of the new oligonucleotides which are fragments of the Vβ sequences according to the invention.
Quant aux séquences qui diffèrent par un ou deux nucléo- tides, elles correspondent à des variations que l'on a observé expérimentalement lors de la détermination de la séquence nucléotidique de plusieurs ADNc.  As for the sequences which differ by one or two nucleotides, they correspond to variations which have been observed experimentally during the determination of the nucleotide sequence of several cDNAs.
La présente invention a également pour objet les peptides codés par des séquences nucléotidiques selon l'invention ainsi que les allèles et les dérivés de ceux-ci qui possèdent la même fonction.  The subject of the present invention is also the peptides encoded by nucleotide sequences according to the invention as well as the alleles and the derivatives thereof which have the same function.
D'une manière générale, la présente invention englobe les peptides constitués par ou comprenant une séquence peptidique codée par les séquences nucléotidiques selon l'invention ainsi que les fragments de ces peptides. Elle englobe également les peptides qui diffèrent de ceux-ci d'un ou plusieurs  In general, the present invention encompasses the peptides constituted by or comprising a peptide sequence encoded by the nucleotide sequences according to the invention as well as the fragments of these peptides. It also includes peptides which differ from these by one or more
aminoacides et qui possèdent la même fonction. Ces peptides peuvent correspondre à des modifications telles que celles connues avec les mutéines ou à des variations allèliques. Il a en effet été montré en particulier que certains segments géniques codant pour des régions variables de chaînes du récepteur T chez l'homme étaient soumis à un phénomène de polymorphisme génétique appelé variation allèlique (29). La présente invention englobe les peptides provenant de ce amino acids and which have the same function. These peptides can correspond to modifications such as those known with muteins or to allelic variations. It has in fact been shown in particular that certain gene segments coding for variable regions of T receptor chains in humans are subject to a phenomenon of genetic polymorphism called allelic variation (29). The present invention encompasses peptides from this
phénomène. phenomenon.
Les séquences nucléotidiques selon l'invention ont été obtenues selon les étapes suivantes :  The nucleotide sequences according to the invention were obtained according to the following steps:
- isolement des ARN de lymphocytes périphériques d'un individu ; - isolation of RNA from peripheral lymphocytes from a individual;
- obtention de l'ADN complémentaire à l'aide de reverse transcriptase et d'une amorce A spécifique de la région Cβ (SEQ ID Nº 20) ;  - Obtaining complementary DNA using reverse transcriptase and a primer A specific for the Cβ region (SEQ ID No. 20);
- amplification génique (par Anchored Polymérase Chain Reaction ou A-PCR) à l'aide d'une ADN polymérase, d'une amor poly C (SEQ ID Nº 21) et d'une amorce B spécifique de la région Cβ (SEQ ID Nº 22) ;  - gene amplification (by Anchored Polymerase Chain Reaction or A-PCR) using a DNA polymerase, a poly C amor (SEQ ID No 21) and a primer B specific for the Cβ region (SEQ ID Nº 22);
- nouvelle amplification par A-PCR à l'aide de ADN poly mérase et d'une amorce C spécifique de la région Cβ (SEQ ID Nº - new amplification by A-PCR using DNA polymerase and a primer C specific for the Cβ region (SEQ ID No
23) ; 23);
- insertion dans un vecteur plasmidique ;  - insertion into a plasmid vector;
- transformation d'un hôte bactérien avec le vecteur recombinant ;  - transformation of a bacterial host with the recombinant vector;
- criblage des colonies bactériennes recombinantes avec un oligonucléotide D spécifique de Cβ (SEQ ID Nβ 24) marqué ;  - screening of recombinant bacterial colonies with a Cβ specific oligonucleotide D (SEQ ID Nβ 24) labeled;
- extraction des plasmides des colonies positives,  - extraction of plasmids from positive colonies,
- et séquençage des fragments d'ADN contenant la région Cβ .  - and sequencing of DNA fragments containing the Cβ region.
La présente invention peut être reproduite notamment par amplification génique bispécifique (polymérase chain reaction ou PCR) en partant de lymphocytes périphériques exprimant les ARNm incluant les segments β variables ou jonctionnels correspondant aux séquences ID Nº 2 à 19 de l'invention ou alternativement en appliquant cette technique de PCR à de l'ADN génomique de toute cellule somatique d'un individu pris au hasard. L'invention peut aussi bien être reproduite en préparant les séquences géniques ci-dessus par synthèse chimique d'oligonucléotides.  The present invention can be reproduced in particular by bispecific gene amplification (polymerase chain reaction or PCR) starting from peripheral lymphocytes expressing the mRNAs including the variable or junctional β segments corresponding to the sequences ID No. 2 to 19 of the invention or alternatively by applying this PCR technique to genomic DNA of any somatic cell of an individual taken at random. The invention can also be reproduced by preparing the above gene sequences by chemical synthesis of oligonucleotides.
Les peptides selon l'invention peuvent être obtenus par synthèse peptidique classique. Ils peuvent être également obtenus par application des techniques connues de génie génétique comprenant l'insertion d'une séquence d'ADN codant pour un peptide selon l'invention dans un vecteur d'expression tel qu'un plasmide et la transformation de cellules avec ce vecteur d'expression.  The peptides according to the invention can be obtained by conventional peptide synthesis. They can also be obtained by application of known techniques of genetic engineering comprising the insertion of a DNA sequence coding for a peptide according to the invention in an expression vector such as a plasmid and the transformation of cells with this expression vector.
La présente invention a donc également pour objet des plasmides et des vecteurs d'expression comprenant une séquence d'ADN codant pour un peptide selon l'invention ainsi que hôtes transformés avec ce vecteur. The present invention therefore also relates to plasmids and expression vectors comprising a sequence DNA encoding a peptide according to the invention as well as hosts transformed with this vector.
La présente invention a également pour objet des anticorps et notamment des anticorps monoclonaux, dirigés contre un déterminant antigénique appartenant à ou comprenant un peptide selon l'invention.  The present invention also relates to antibodies and in particular monoclonal antibodies, directed against an antigenic determinant belonging to or comprising a peptide according to the invention.
Les anticorps monoclonaux peuvent être obtenus par toute les techniques qui permettent la production de molécules d'anticorps à partir de culture de lignée cellulaire. Ces techniques comprennent les différentes techniques utilisant des hybridomes.  Monoclonal antibodies can be obtained by any technique which allows the production of antibody molecules from cell line culture. These techniques include the various techniques using hybridomas.
La production d'anticorps peut être obtenue chez l'animal par immunisation des animaux par injection des peptides ou des fragments selon l'invention, qu'ils soient naturels, recombinants ou synthétiques, éventuellement après couplage à un agent immunogène tel que l'anatoxine tétanique, ou encore par injection de lymphocytes T humains exprimant les séquences correspondantes à leur surface, y compris des cellules recombinantes transfectées avec les séquences codantes correspondantes.  The production of antibodies can be obtained in animals by immunization of animals by injection of the peptides or fragments according to the invention, whether they are natural, recombinant or synthetic, optionally after coupling with an immunogenic agent such as toxoid tetanus, or by injection of human T lymphocytes expressing the corresponding sequences on their surface, including recombinant cells transfected with the corresponding coding sequences.
La présente invention a également pour objet des hybridomes produisant des anticorps monoclonaux dirigés contre les polypeptides selon l'invention.  The present invention also relates to hybridomas producing monoclonal antibodies directed against the polypeptides according to the invention.
La présente invention englobe également les fragments et les dérivés d'anticorps monoclonaux selon l'invention qui sont réactifs avec des régions variables définies des récepteurs des cellules T. Ces fragments sont notamment les fragments F(ab')2 qui peuvent être obtenus par clivage enzymatique des molécules d'anticorps avec la pepsine, les fragments Fab' qui peuvent être obtenus par réduction des ponts disulfure des fragments F(ab')2 et les fragments Fab qui peuvent être obtenus par clivage enzymatique des molécules d'anticorps avec la papaïne en présence d'un agent réducteur. Les fragments peuvent être également obtenus par génie génétique.  The present invention also encompasses the fragments and derivatives of monoclonal antibodies according to the invention which are reactive with defined variable regions of T cell receptors. These fragments are in particular the F (ab ′) 2 fragments which can be obtained by cleavage enzymatic antibody molecules with pepsin, the Fab 'fragments which can be obtained by reduction of the disulfide bridges of the F (ab') 2 fragments and the Fab fragments which can be obtained by enzymatic cleavage of the antibody molecules with papain in the presence of a reducing agent. The fragments can also be obtained by genetic engineering.
Les dérivés d'anticorps monoclonaux sont par  Monoclonal antibody derivatives are by
exemple des anticorps ou des fragments de ces anticorps example of antibodies or fragments of these antibodies
auxquels sont liés des marqueurs tel qu'un radioisotope. Les dérivés d'anticorps monoclonaux sont également des anticorps ou des fragments de ces anticorps auxquels sont liées des molécules thérapeutiquement actives, notamment des composés cytotoxiques. to which are linked markers such as a radioisotope. Monoclonal antibody derivatives are also antibodies or fragments of these antibodies to which therapeutically active molecules are linked, in particular cytotoxic compounds.
Les produits de l'invention trouvent plusieurs types d'application dans le domaine du diagnostic et dans le domain de la thérapeutique.  The products of the invention find several types of application in the field of diagnosis and in the field of therapy.
1 - Les applications dans le domaine du diagnostic 1 - Applications in the field of diagnostics
Les oligonucléotides contenus dans les séquences nucléotidiques selon l'invention peuvent être utilisés pour constituer des sondes de détection (généralement au moins 10 nucléo- tides) capables de s'hybrider à une région variable d'une chaîne β ou des amorces pour l'amplification d'ADN (comportant généralement au moins 15 nucléotides et de préférence au moins 17 nucléotides) capables de se lier à une séquence à amplifier.  The oligonucleotides contained in the nucleotide sequences according to the invention can be used to constitute detection probes (generally at least 10 nucleotides) capable of hybridizing to a variable region of a β chain or primers for amplification DNA (generally comprising at least 15 nucleotides and preferably at least 17 nucleotides) capable of binding to a sequence to be amplified.
Les oligonucléotides trouvent ainsi une application dans le diagnostic des désordres immunitaires en détectant la présence de séquences d'acides nucléiques homologues d'un gène codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des cellules T dans l'ARNm d'un échantillon d'un patient.  The oligonucleotides thus find an application in the diagnosis of immune disorders by detecting the presence of nucleic acid sequences homologous to a gene coding for variable regions of β chains of T cell receptors in the mRNA of a sample of a patient.
Différentes méthodes peuvent être utilisées pour établir un lien entre l'expression des gènes des cellules T et une maladie. Ces méthodes comprennent : Different methods can be used to link the expression of T cell genes to a disease. These methods include:
a - la production et l'analyse de banques d'expressions d'ADNc obtenu à partir de cellules T liées à la maladie pour déterminer la fréquence de gènes dominants ;  a - production and analysis of expression cDNA libraries obtained from T cells linked to the disease to determine the frequency of dominant genes;
b - l'analyse d'échantillons d'ADN génomique par Southern blot pour déterminer s'il existe des polymorphismes génétiques ou des réarrangements des gènes codant pour les récepteurs des cellules T ;  b - analysis of genomic DNA samples by Southern blot to determine whether there are genetic polymorphisms or rearrangements of the genes coding for the T cell receptors;
c - l'analyse d'échantillons par obtention d'ADNc, amplification par PCR et hybridation avec des sondes marquées ;  c - analysis of samples by obtaining cDNA, amplification by PCR and hybridization with labeled probes;
d - l'hybridation in situ de cellules T sans culture préalable des cellules T.  d - in situ hybridization of T cells without prior culture of T cells.
Les amorces trouvent une application dans des réactions de PCR dans une méthode telle que celle définie sous c.  The primers find application in PCR reactions in a method such as that defined under c.
Les anticorps monoclonaux, les fragments ou les dérivés de ces anticorps selon l'invention peuvent être utilisés pour étudier des réponses immunitaires de type T, par exemple dans le domaine des maladies auto-immunes de la cancérologie, de l'allergie, de la transplantation et des maladies infectieuses. En particulier, le répertoire des différents segments variables β du récepteur T peut être étudié, qu'il s'agisse de cellules T du sang ou des tissus. D'une manière générale, les techniques utilisées peuvent être des méthodes in vitro ou in vivo. Monoclonal antibodies, fragments or derivatives of these antibodies according to the invention can be used to study type T immune responses, for example in the field of autoimmune diseases of oncology, allergy, transplantation and infectious diseases. In particular, the repertoire of the different variable β segments of the T receptor can be studied, whether they are blood T cells or tissues. In general, the techniques used can be in vitro or in vivo methods.
Dans les méthodes in vitro, les échantillons utilisés peuvent être des échantillons de fluides corporels ou des échantillons de tissus. Les techniques utilisées peuvent inclure notamment la cytofluorimétrie de flux pour analyser les lymphocytes T du sang ou des marquages par immunopéroxydase sur coupe anatomopatho-logique pour étudier les lymphocytes infiltrant les tissus.  In in vitro methods, the samples used can be samples of body fluids or samples of tissue. The techniques used can notably include flow cytofluorimetry to analyze T lymphocytes in the blood or immunoperoxidase labeling on anatomopathological section to study lymphocytes infiltrating tissue.
Dans les méthodes in vivo, les anticorps, leurs fragments ou leurs dérivés sont administrés par les voies habituelles, par exemple par la voie intraveineuse, et l'on détecte les liaisons immunospécifiques. Ceci peut être obtenu par exemple dans le cas où l'on utilise un anticorps marqué par un radioisotope.  In in vivo methods, the antibodies, their fragments or their derivatives are administered by the usual routes, for example by the intravenous route, and the immunospecific bonds are detected. This can be obtained for example in the case where an antibody labeled with a radioisotope is used.
2 - Les applications dans le domaine thérapeutique 2 - Applications in the therapeutic field
Les oligonucléotides contenus dans les séquences nucléotidiques selon l'invention peuvent être utilisés en thérapeutique comme oligonucléotides antisens. On sait en effet qu'il est possible in vitro d'inhiber l'expression d'un gène transcrit dans des lymphocytes humains en incubant ces lymphocytes avec un olignoculéotide antisens spécifique du gène en question (30). Ces oligonucléotides antisens comprennent généralement au moins 10 et de préférence au moins 16 nucléotides. Ces oligonucléotides antisens peuvent être notamment les séquences inversées et complémentées correspondant aux 20 nucléotides en amont du site d'inititation de la traduction (ATG). L'intérêt d'une utilisation in vitro d'oligonucléotides antisens spécifique d'un segment génique Vβ est d'abolir (ou de diminuer fortement) l'expression d'un récepteur T comprenant ce segment Vβ et donc d'obtenir un phénomène de délétion clonale au niveau de la réactivité spécifique des lymphocytes T. Les oligonucléotides antisens peuvent non seulement être utilisés in vitro sur des lymphocytes T humains qui sont ensuite réinjectés, mais également in vivo par injection locale ou systémique de préférence après modification pour augmenter la stabilité in vivo et la pénétration à l'intérieur des lymphocytes de ces oligonucléotides. The oligonucleotides contained in the nucleotide sequences according to the invention can be used in therapy as antisense oligonucleotides. It is known in fact that it is possible in vitro to inhibit the expression of a gene transcribed in human lymphocytes by incubating these lymphocytes with an antisense olignoculeotide specific for the gene in question (30). These antisense oligonucleotides generally comprise at least 10 and preferably at least 16 nucleotides. These antisense oligonucleotides can in particular be the inverted and complemented sequences corresponding to the 20 nucleotides upstream from the translation initiation site (ATG). The advantage of using in vitro antisense oligonucleotides specific for a Vβ gene segment is to abolish (or reduce strongly) the expression of a T receptor comprising this Vβ segment and therefore of obtaining a clonal deletion phenomenon at the level of the specific reactivity of T lymphocytes. The antisense oligonucleotides can not only be used in vitro on human T lymphocytes which are then reinjected, but also in vivo by local or systemic injection preferably after modification to increase the stability in vivo and the penetration inside the lymphocytes of these oligonucleotides.
Les anticorps monoclonaux selon l'invention peuvent être utilisés pour moduler le système immunitaire. C'est ainsi que les anticorps peuvent être administrés pour bloquer l'interaction des cellules T effectrices avec leur antigène spécifique. On peut également administrer des anticorps anti-récepteurs T liés par exemple à une molécule cytotoxique ou à un radioisotope de façon à obtenir une délétion clonale, grâce à la fixation spécifique sur une chaîne β d'un récepteur de cellule T. Les anticorps monoclonaux selon l'invention peuvent être utilisés en thérapeutique à des concentrations faiblement mitogéniques de façon à activer de façon spécifique certains sous-ensembles de cellules T ou peuvent être utilisés à des concentrations beaucoup plus élevées pour se fixer aux récepteurs concernés et ainsi marquer ces sous-ensembles en vue de leur élimination par le système réticulo-endothélial. Un critère important pour le traitement d'une maladie est l'aptitude à moduler des sous-ensembles de cellules T liées à une maladie. La nature exacte de cette modulation thérapeutique, savoir bloquer ou supprimer un sous-ensemble particulier de cellules T ou au contraire stimuler et activer un  The monoclonal antibodies according to the invention can be used to modulate the immune system. This is how antibodies can be administered to block the interaction of effector T cells with their specific antigen. It is also possible to administer anti-T receptor antibodies linked for example to a cytotoxic molecule or to a radioisotope so as to obtain a clonal deletion, by virtue of the specific binding to a β chain of a T cell receptor. The monoclonal antibodies according to the invention can be used therapeutically at low mitogenic concentrations so as to specifically activate certain subsets of T cells or can be used at much higher concentrations to bind to the receptors concerned and thus mark these subsets for elimination by the reticuloendothelial system. An important criterion for the treatment of a disease is the ability to modulate subsets of T cells linked to a disease. The exact nature of this therapeutic modulation, namely blocking or suppressing a particular subset of T cells or, on the contrary, stimulating and activating a
sous-ensemble particulier, dépendra de la maladie en question et du sous-ensemble spécifique de cellules T concerné. particular subset, will depend on the disease in question and the specific subset of T cells involved.
Ce type de traitement présente un avantage par rapport aux traitements actuels utilisant des anticorps tels que le traitement par des anticorps anti CD3 chez des patients ayant subi une transplantation rénale et ayant un problème de rejet étant donné que grâce à l'invention il n'y aura pas de modulation de la totalité de la population des cellules T mais seulement du sous-ensemble de cellules T exprimant la sous-famille β particulière de récepteurs de cellules T. This type of treatment has an advantage compared to current treatments using antibodies such as treatment with anti CD3 antibodies in patients who have undergone a renal transplant and who have a rejection problem since, thanks to the invention, there is no will not modulate the entire T cell population but only the subset of T cells expressing the specific β subfamily of T cell receptors
Par ailleurs, la réponse des cellules T étant souvent oligoclonale, il convient généralement d'utiliser en thérapeu- tique des "cocktails" de plusieurs anticorps.  Furthermore, since the T cell response is often oligoclonal, it is generally advisable to use in therapy "cocktails" of several antibodies.
On peut en outre utiliser les anticorps anti Vβ pour sélectionner in vitro des lymphocytes T, par exemple par passage sur une colonne contenant des billes portant l'anticorps. Cette séparation de certains lymphocytes T peut être utilisée en vue d'une mise en culture de ces lymphocytes avant de les réinjecter au patient.  In addition, anti-Vβ antibodies can be used to select T cells in vitro, for example by passing through a column containing beads carrying the antibody. This separation of certain T lymphocytes can be used with a view to culturing these lymphocytes before reinjecting them into the patient.
En outre, on peut utiliser en thérapeutique tout ou partie des séquences peptidiques selon l'invention,  In addition, all or part of the peptide sequences according to the invention can be used in therapy,
c'est-à-dire les séquences peptidiques codées par les  that is to say the peptide sequences encoded by
séquences nucléotidiques selon l'invention ou les fragments de ces séquences (comprenant généralement au moins 8 à 10 amino- acides). Ces séquences ou fragments administrés à l'homme ou à l'animal, peuvent agir en tant que leurre, c'est-à-dire qu'ils vont se fixer sur l'épitope porté par l'antigène néfaste et empêcher la réaction des cellules T normales avec l'antigène, en empêchant ainsi le développement d'une maladie agressive contre les déterminants du soi. Ils peuvent aussi être utilisés en tant qu'immunogènes dans la fabrication de vaccins (éventuellement après couplage à des porteurs protéiques).  nucleotide sequences according to the invention or the fragments of these sequences (generally comprising at least 8 to 10 amino acids). These sequences or fragments administered to humans or animals, can act as a decoy, that is to say that they will bind to the epitope carried by the harmful antigen and prevent the reaction of normal T cells with the antigen, thereby preventing the development of an aggressive disease against self-determinants. They can also be used as immunogens in the manufacture of vaccines (possibly after coupling with protein carriers).
On décrira ci-après plus en détail la présente invention, en se reportant aux Fig. annexées sur lesquelles :  The present invention will be described in more detail below, with reference to Figs. annexed on which:
- les Fig. 1 à 6 donnent en alignement à la fois des séquences Vβ connues et des séquences partielles des nouvelles séquences selon l'invention (SEQ ID Nº 6 à 19), notées IGRa 08 à IGRa 20 appartenent à des sous-familles Vβ connues. Sur ces Figures, la numérotation des nucléotides commence au codon ATG d'initiation (qui est souligné). Les points indiquent les nucléotides identiques. Les séquences qui sont supposées être des séquences leader sont surlignées.  - Figs. 1 to 6 give in alignment both known Vβ sequences and partial sequences of the new sequences according to the invention (SEQ ID Nos. 6 to 19), denoted IGRa 08 to IGRa 20 belong to known Vβ subfamilies. In these Figures, the numbering of the nucleotides begins at the initiation ATG codon (which is underlined). The dots indicate the identical nucleotides. Sequences that are assumed to be leader sequences are highlighted.
- La Fig. 7 donne les analyses par Southern blot de l'ADN génomique traité par une enzyme de restriction en utilisant des sondes spécifiques des sous-familles Vβ . Les enzymes de restriction utilisées sont EcoR I (colonne R), Hind III  - Fig. 7 gives the Southern blot analyzes of the genomic DNA treated with a restriction enzyme using probes specific for the Vβ subfamilies. The restriction enzymes used are EcoR I (column R), Hind III
(colonne H) et BamH I (colonne B). Sur cette Figure, les triangles marquent les positions des fragments d'ADN (column H) and BamH I (column B). In this Figure, the triangles mark the positions of DNA fragments
s'hybridant de façon spécifique avec Cβ .  specifically hybridizing with Cβ.
- La Fig. 8 représente la détection par autoradiographie des transcrits amplifiés des chaînes β du TCR exprimé par les lymphocytes périphériques d'un individu sain, et du contrôle β-actine co-amplifié.  - Fig. 8 represents the detection by autoradiography of the amplified transcripts of the β chains of the TCR expressed by the peripheral lymphocytes of a healthy individual, and of the co-amplified β-actin control.
- La Fig. 9 représente l'analyse par cytofluorimétrie de la réactivité de l'anticorps monoclonal RO-73 respectivement vis-à-vis du clone immunisant 3025 (9A), du clone 12410 (9B) et des lymphocytes circulants (9C).  - Fig. 9 represents the analysis by cytofluorimetry of the reactivity of the monoclonal antibody RO-73 respectively with respect to the immunizing clone 3025 (9A), the clone 12410 (9B) and the circulating lymphocytes (9C).
La réactivité-témoin des anticorps NKTa ou OKT3 est donnée respectivement pour chaque type de cellule. The control reactivity of the NKTa or OKT 3 antibodies is given respectively for each type of cell.
Le nombre de cellules comptées (échelle linéaire) est donné en fonction de l'intensité de la fluorescence (échelle logarithmique).  The number of cells counted (linear scale) is given as a function of the intensity of the fluorescence (logarithmic scale).
- La Fig. 10 représente l'analyse par cytofluorimétrie de la réactivité de l'anticorps monoclonal JU-74 (Fig. 10A, 10B, 10C : mêmes conditions que pour les Fig. 9A, 9B, 9C).  - Fig. 10 represents the cytofluorimetry analysis of the reactivity of the monoclonal antibody JU-74 (FIGS. 10A, 10B, 10C: same conditions as for FIGS. 9A, 9B, 9C).
- La Fig. 11 représente l'analyse par cytofluorimétrie de la comodulation avec la molécule CD3 de la structure TCR du clone 3025 reconnue par l'anticorps monoclonal R0-73 respectivement en absence (Fig. 11A) ou en présence d'anticorps anti-CD3 (Fig. 11B).  - Fig. 11 shows the cytofluorimetry analysis of the co-modulation with the CD3 molecule of the TCR structure of clone 3025 recognized by the monoclonal antibody R0-73 respectively in the absence (Fig. 11A) or in the presence of anti-CD3 antibodies (Fig. 11B).
La comodulation-témoin est donnée respectivement avec le anticorps monoclonaux NKTa, OKT3 et anti-CD2.  The co-control is given respectively with the monoclonal antibodies NKTa, OKT3 and anti-CD2.
- La Fig. 12 représente l'analyse par cytofluo-rimétrie de la comodulation avec la molécule CD3 de la structure TCR du clone 3025 reconnue par l'anticorps monoclonal JU-73, respectivement en absence (Fig. 12A) ou en présence d'anticorps anti-CD3 (Fig. 12B).  - Fig. 12 represents the cytofluorimetric analysis of the co-modulation with the CD3 molecule of the TCR structure of clone 3025 recognized by the monoclonal antibody JU-73, respectively in the absence (FIG. 12A) or in the presence of anti-CD3 antibodies (Fig. 12B).
- La Fig. 13 représente la détection par autoradiographie des transcrits amplifiés des chaînes a (Fig. 13A) et des chaînes β (Fig. 13B) du TCR exprimé par les cellules RO-73+. I - Obtention de l'ADNc et amplification par PCR - Fig. 13 represents the detection by autoradiography of the amplified transcripts of the a chains (FIG. 13A) and of the β chains (FIG. 13B) of the TCR expressed by the RO-73 + cells. I - Obtaining the cDNA and amplification by PCR
On a utilisé comme source d'ARN des lymphocytes périphériques d'un individu. L'ARN total a été préparé selon la méthode à l'isothiocyanate de guanidinium et au chlorure de césium (Chirgwin (12)) ou selon la méthode en une seule étape par extraction avec de l'isothiocyanate de guanidinium, du phénol et du chloroforme (Chomczynski (13)). Peripheral lymphocytes from an individual were used as the RNA source. Total RNA was prepared according to the guanidinium isothiocyanate and cesium chloride method (Chirgwin (12)) or the one-step method by extraction with guanidinium isothiocyanate, phenol and chloroform (Chomczynski (13)).
Le premier brin d'ADNc a été synthétisé dans un volume final de 50 microlitres à une température de 42º C pendant 1 heure en utilisant 5 microgrammes d'ARN total, la reverse transcriptase et une amorce A spécifique de la région Cβ constituée par la séquence 5'-TATCTGGAGTCA TTGAGGGCGGGC (SEQ ID Nº 20). Ce matériau a été ensuite purifié par extraction au phénol/chloroforme et précipitation à l'acétate d'ammonium. Après sélection d'une fraction 0,45/1 kb sur gel d'agarose, on a réalisé l'addition d'une extrémité dG sur l'hétéro duplex ARN/ADNc dans un tampon d'addition COCl2 avec 14 unités de terminal désoxynucléotidyl transferase (Tdt) pendant 30 mn à 37° C. La réaction a été stoppée par maintien à 70º C pendant 10 mn. NaOH 1N (1/3 de volume) a été ajouté et l'échantillon a été mis à incuber à 50° C pendant 1 heure pour hydrolyser l'ARN puis a été neutralisé avec du Tris HCl 2M pH 8 et HCl 1N. Après extraction par un mélange phénol/ chloroforme le premier brin d'ADNc à extrémité G a été précipité avec de l'éthanol et soumis à une amplification en utilisant la technique PCR (Polymérase Chain Reaction décrite par Saiki et al. (14)) dans un volume final de 100 microlitres contenant 50 mM de KCl, 10 mM de Tris-Ci pH 8.3, 1,5 mM de MgCl2, 0,1 % The first strand of cDNA was synthesized in a final volume of 50 microliters at a temperature of 42º C for 1 hour using 5 micrograms of total RNA, reverse transcriptase and a primer A specific for the Cβ region constituted by the sequence 5'-TATCTGGAGTCA TTGAGGGCGGGC (SEQ ID Nº 20). This material was then purified by extraction with phenol / chloroform and precipitation with ammonium acetate. After selection of a 0.45 / 1 kb fraction on agarose gel, the addition of a dG end was carried out on the hetero duplex RNA / cDNA in a COCl 2 addition buffer with 14 terminal units deoxynucleotidyl transferase (Tdt) for 30 min at 37 ° C. The reaction was stopped by maintaining at 70 ° C for 10 min. 1N NaOH (1/3 volume) was added and the sample was incubated at 50 ° C for 1 hour to hydrolyze the RNA and then was neutralized with 2 M Tris HCl pH 8 and 1N HCl. After extraction with a phenol / chloroform mixture, the first strand of G-terminated cDNA was precipitated with ethanol and subjected to amplification using the PCR (Polymerase Chain Reaction technique described by Saiki et al. (14)) in a final volume of 100 microliters containing 50 mM KCl, 10 mM Tris-Ci pH 8.3, 1.5 mM MgCl 2 , 0.1%
(poids/ volume) de gélatine, 200 micromoles de dNTP, 2,5 unités de Taq polymérase et 100 picomoles de deux amorces. Les deux amorces utilisées sont, d'une part, une amorce poly-C (5'-GCATGCGCGCGGCC GCGGAGG-14C) (SEQ ID Nº 21) décrite par Loh et al. (15) ainsi qu'une amorce B spécifique de la région Cβ (5'-TGTGGCCAGGCATGCCAGTGTGGCC) (SEQ ID Nº 22).  (weight / volume) of gelatin, 200 micromoles of dNTP, 2.5 units of Taq polymerase and 100 picomoles of two primers. The two primers used are, on the one hand, a poly-C primer (5'-GCATGCGCGCGGCC GCGGAGG-14C) (SEQ ID No 21) described by Loh et al. (15) as well as a primer B specific for the Cβ region (5'-TGTGGCCAGGCATGCCAGTGTGGCC) (SEQ ID No. 22).
On effectue 25 cycles d'amplification suivis par une période de 15 mn d'élongation finale à 72º C. Chaque cycle comprend une étape de dénaturâtion à 92° C pendant 1 minute, une étape d'hybridation à 55° C pendant 2 mn et une période d'élongation à 72° C pendant 4 mn. Les produits amplifiés sont ensuite précipités par de l'éthanol, remis en suspension dans de l'acétate de sodium 30 mM pH5, NaCl 50 mM, ZnCl2 1 mM, glycérol 5 % en volume, et 1/10 de ce matériau est purifié en fonction de la taille sur un gel d'agarose à bas point de fusion 1 %. 25 amplification cycles are carried out followed by a 15 min period of final elongation at 72 ° C. Each cycle comprises a denaturation step at 92 ° C for 1 minute, a hybridization step at 55 ° C for 2 min and an elongation period at 72 ° C for 4 min. The amplified products are then precipitated with ethanol, resuspended in 30 mM sodium acetate pH5, 50 mM NaCl, 1 mM ZnCl 2 , glycerol 5% by volume, and 1/10 of this material is purified according to the size on an agarose gel with low melting point 1%.
Une seconde phase d'amplification est ensuite réalisée directement sur approximativement 10 % de la bande contenant l'agarose en suivant les mêmes conditions que précédemment, sauf qu'on utilise comme amorce C spécifique de la région Cβ l'amorce 5'-GGTGTGGGAGAA TTCTGCTTCTGA (SEQ ID Nº 23). Le mélange de réaction est ensuite précipité par l'éthanol et remis en suspension dans 60 μl HUO.  A second amplification phase is then carried out directly on approximately 10% of the band containing the agarose following the same conditions as above, except that the primer C specific for the Cβ region is used the primer 5'-GGTGTGGGAGAA TTCTGCTTCTGA (SEQ ID Nº 23). The reaction mixture is then precipitated with ethanol and resuspended in 60 μl HUO.
II - Clonage et séguençage des ADNc II - Cloning and sequencing of cDNAs
1/3 du produit de la seconde amplification est mis à digérer avec Sac II, séparé sur gel d'agarose 1 % et purifié par adsorption sur des billes de verre. Le matériau est inséré dans le vecteur Bluescript SK+ (Stratagene, La Jolla, U.S.A.) et les recombinants obtenus sont utilisés pour transformer des souches XLl-bleu de E. Coli (Stratagene). Après dépôt en présence de X-gal et IPTG, on fait un test sur les colonies blanches en utilisant une technique "dot blot" et comme sonde un troisième oligonucléotide spécifique de la région Cβ 1/3 of the product of the second amplification is digested with Sac II, separated on 1% agarose gel and purified by adsorption on glass beads. The material is inserted into the Bluescript SK + vector (Stratagene, La Jolla, USA) and the recombinants obtained are used to transform XLl-blue strains of E. Coli (Stratagene). After deposition in the presence of X-gal and IPTG, a test is carried out on the white colonies using a "dot blot" technique and as a probe a third oligonucleotide specific for the Cβ region
(5'-TCTGCTTCT GATGGCTCAA) (SEQ ID N° 24) marqué au 32 P. On extrait l'ADN plasmidique des colonies positives et on (5'-TCTGCTTCT GATGGCTCAA) (SEQ ID No. 24) labeled with 32 P. The plasmid DNA is extracted from the positive colonies and
séquence sur les deux brins par le procédé par terminaison de chaîne didésoxy (Sanger et al. (16)) avec de la Sequenase 2,0 (United States Biochemicals, Cleveland, Etats-Unis) en suivant les recommandations du fournisseur. sequence on both strands by the dideoxy chain termination method (Sanger et al. (16)) with Sequenase 2.0 (United States Biochemicals, Cleveland, USA) following the supplier's recommendations.
Les séquences obtenues ont été comparées aux séquences publiées Vβ en utilisant la méthode développée par Lipman et Pearson (17). Les codons de départ présumés ont été identifiés en recherchant la présence de la séquence consensus Kozak pour les sites d'initiation des traductions dans les cellules eucaryotes (Kozak (18)). La présence de séquences leader hydrophobes du côté N-terminal a été décelée par analyse de l'hydrophobicité selon la méthode décrite par Kyte (19). III - Analyse par Southern blot The sequences obtained were compared to the published Vβ sequences using the method developed by Lipman and Pearson (17). The presumed start codons were identified by looking for the presence of the Kozak consensus sequence for the translation initiation sites in eukaryotic cells (Kozak (18)). The presence of hydrophobic leader sequences on the N-terminal side was detected by hydrophobicity analysis according to the method described by Kyte (19). III - Southern blot analysis
L'ADN a été extrait de la lignée cellulaire érythroleucé mique humaine K562 et mis à digérer avec l'une des enzymes de restriction suivantes : Eco RI, BamH I ou Hind III. L'ADN (15 microgrammes) a été soumis à une électrophorèse sur agarose 0,7 % et a été transféré sur des membranes de Nylon comme décrit par Triebel et al. (20). Les hybridations ont été réalisées à 65° C avec 6 × SSC, 0,5 % de SDS, 5 × Denhardt's et 100 microgrammes d'ADN de sperme de saumon dénaturé pendan 16 heures. Les membranes ont été lavées à 65° C avec 2 × SSC, 0,2 % de SDS. The DNA was extracted from the human erythroleucic cell line K562 and digested with one of the following restriction enzymes: Eco RI, BamH I or Hind III. The DNA (15 micrograms) was subjected to 0.7% agarose electrophoresis and was transferred to nylon membranes as described by Triebel et al. (20). Hybridizations were carried out at 65 ° C. with 6 × SSC, 0.5% SDS, 5 × Denhardt's and 100 micrograms of denatured salmon sperm DNA within 16 hours. The membranes were washed at 65 ° C with 2 × SSC, 0.2% SDS.
On a utilisé comme sondes Vβ spécifiques des sondes obtenues par amplification d'ADNc V-J-C en utilisant comme amorce l'amorce poly-C et l'amorce C. Les sondes ont été purifiées sur gel d'agarose 1 %. Des sondes d'ADN marquées au 32P ont été préparées à partir des fragments purifiés sur agarose par la méthode de Feinberg (21). IV - Résultats As the specific Vβ probes, probes obtained by amplification of VJC cDNA were used, using the primer poly-C and primer C. The probes were purified on 1% agarose gel. DNA probes labeled with 3 2 P were prepared from the fragments purified on agarose by the method of Feinberg (21). IV - Results
En utilisant la méthode A-PCR, 350 ADNc qui hybrident avec la sonde Cβ ont été clones, puis séquences. Parmi ceux-ci, 226 ADNc correspondent à des régions variables V-J-Cβ uniques.  Using the A-PCR method, 350 cDNAs which hybridize with the Cβ probe were cloned, then sequenced. Of these, 226 cDNAs correspond to unique V-J-Cβ variable regions.
Les séquences Vβ de L'invention figurent dans la liste des séquences sous les SEQ ID N" 2 à 19. Les séquences SEQ ID N" 3 à 5 correspondent à 3 sous familles nouvelles tandis que les séquences SEQ ID N° 2 et 6 à 19 correspondent à de  The Vβ sequences of the invention appear in the list of sequences under SEQ ID N "2 to 19. The SEQ ID N" 3 to 5 correspond to 3 new sub-families while the SEQ ID No. 2 and 6 to 19 correspond to
nouveaux membres de sous-familles Vβ connues ou à des extensions de segments Vβ connus. new members of known Vβ subfamilies or extensions of known Vβ segments.
Sous-famille Vβ w21 (SEQ ID Nº 2) Subfamily Vβ w21 (SEQ ID Nº 2)
Cette sous-famille a été identifiée par le clone IGR b02 (SEQ ID N° 2).  This subfamily was identified by the clone IGR b02 (SEQ ID No. 2).
Cette séquence présente pour la partie codante une homologie d'environ 85 % avec la séquence HSTCRB23 (Wilson et al. (41)). Sous-famille Vβ w22 (SEQ ID N' 3) This sequence has approximately 85% homology for the coding part with the sequence HSTCRB23 (Wilson et al. (41)). Subfamily Vβ w22 (SEQ ID N '3)
Le segment SEQ ID Nº 3 a été défini comme séquence consensus à partir de 23 clones distincts d'ADNc. On a observ en position 322 un C au lieu d'un T et en position 350 un A a lieu d'un G.  The segment SEQ ID No. 3 was defined as a consensus sequence from 23 distinct cDNA clones. We observed in position 322 a C instead of a T and in position 350 an A takes the place of a G.
Sous-famille Vβ w23 (SEQ ID M' 4) Subfamily Vβ w23 (SEQ ID M '4)
Le segment ID H' 4 a été défini comme séquence consensus à partir de 4 clones distincts. On a observé en position 154 un G au lieu d'un A et en position 160 un A au lieu d'un G. I présente une homologie de 75,7 % avec la séquence VB12A1 (Leiden déjà cité) mais présente une homologie inférieure à 75 % avec les autres membres de la sous-famille Vβ 5 (représentés sur la Fig. 1). Il ne fait donc pas partie de la sous- famille Vβ 5.  The segment ID H ′ 4 was defined as a consensus sequence from 4 distinct clones. We observed in position 154 a G instead of an A and in position 160 an A instead of a G. I has a homology of 75.7% with the sequence VB12A1 (Leiden already cited) but has a lower homology 75% with the other members of the Vβ 5 subfamily (shown in Fig. 1). It is therefore not part of the Vβ 5 subfamily.
Sous-famille Vβ W24 (SEQ ID Nº 5) Subfamily Vβ W24 (SEQ ID Nº 5)
Le segment SEQ ID Nº 5 a été défini à partir de 2 clones distincts d'ADNc.  The SEQ ID Nº 5 segment was defined from 2 distinct cDNA clones.
Les analyses par Southern blot d'ADN de lignée germinale soumis à une digestion par les endonucléases, en utilisant des sondes V-J-Cβ comprenant des fragments Vβ correspondant aux sous-familles Vβ w21 à Vβ w24 ont été réalisées dans des conditions d'hybridation de "faible stringence" pour identifier le nombre de segments géniques Vβ appartenant à chaque famille et pour caractériser des fragments de restriction d'ADN portant ces segments géniques Vβ . Des résultats représentatifs sont reportés sur la Figure 7. Southern blot analyzes of germline DNA subjected to endonuclease digestion, using VJ-Cβ probes comprising Vβ fragments corresponding to the subfamilies Vβ w21 to Vβ w24 were carried out under hybridization conditions of "low stringency" to identify the number of Vβ gene segments belonging to each family and to characterize restriction fragments of DNA carrying these Vβ gene segments. Representative results are shown in Figure 7.
Ces analyses sont compatibles avec la présence dans les cellules érythroleucémiques K 562 d'au moins trois segments géniques pour la sous-famille V w21, deux pour la  These analyzes are compatible with the presence in erythroleukemic cells K 562 of at least three gene segments for the subfamily V w21, two for the
sous-famille Vβ w23 et un pour les sous-familles Vβ w22 et Vβ W24. sub-family Vβ w23 and one for the sub-families Vβ w22 and Vβ W24.
Les tailles des fragments de restriction de l'ADN germinal sont les suivantes :  The sizes of the restriction fragments of the germinal DNA are as follows:
Vβ W21 : ECOR I 1,7-, 3- et 6,5 kb, Hind III 2,5-, 7,2-, 11,7-, 14- et 18 kb, BamH I 5,5-, 16,5- et 23 kb; Vβ W22 ; EcoR I 2,8 kb, Hind III 8,8 kb, BamH I 5,3 kb; Vβ W21: ECOR I 1.7-, 3- and 6.5 kb, Hind III 2.5-, 7.2-, 11.7-, 14- and 18 kb, BamH I 5.5-, 16, 5- and 23 kb; Vβ W22; EcoR I 2.8 kb, Hind III 8.8 kb, BamH I 5.3 kb;
Vβ W23 : EcoR I 3,2- et 4,4 kb, Hind III 7,4-, 15,5- et 16,5 kb, BamH I 2,5- et 5,7 kb ;  Vβ W23: EcoR I 3.2- and 4.4 kb, Hind III 7.4-, 15.5- and 16.5 kb, BamH I 2.5- and 5.7 kb;
Vβ w24 : EcoR I 8 kb, Hind III 20 kb et 7,3 kb, BamH I 11,- et 22 kb.  Vβ w24: EcoR I 8 kb, Hind III 20 kb and 7.3 kb, BamH I 11, - and 22 kb.
Sous-famille Vβ 5 (Fig. 1) : Vβ 5 subfamily (Fig. 1):
SEQ ID N° 6 et 7 (IGR b06 et IGR b07) SEQ ID N ° 6 and 7 (IGR b06 and IGR b07)
Ces séquences présentent une homologie respectivement de 79 à 86 I et de 76 à 70 1 avec les 4 segments précédemment connus VB12A1 (Leiden déjà cité), HBP51 (Kimura (23)), PH24 (Tillinghast déjà cité) et PL25 (Concannon (24)) et représentent de nouveaux membres.  These sequences have a homology of 79 to 86 I and 76 to 70 1 respectively with the 4 previously known segments VB12A1 (Leiden already cited), HBP51 (Kimura (23)), PH24 (Tillinghast already cited) and PL25 (Concannon (24 )) and represent new members.
SEQ ID N° 8 et 9 (IGR b08 et IGR b09) SEQ ID N ° 8 and 9 (IGR b08 and IGR b09)
Ces séquences correspondent à des extensions du côté 5º des clones VB12A1 et PL25 respectivement. Pour SEQ ID Nº 8 deux substitutions de nucléotides sont observées par rapport à VB12A1.  These sequences correspond to extensions of the 5º side of the clones VB12A1 and PL25 respectively. For SEQ ID Nº 8, two nucleotide substitutions are observed with respect to VB12A1.
Sous-famille Vβ 6 (Fig. 2) : Vβ 6 subfamily (Fig. 2):
SEQ ID N° 10 (IGR b11) SEQ ID N ° 10 (IGR b11)
Cette séquence correspond à une extension du côté 5' du clone HBP25 (Kimura, déjà cité).  This sequence corresponds to an extension on the 5 ′ side of the HBP25 clone (Kimura, already cited).
SEQ ID N° 11 (IGR bl2) SEQ ID N ° 11 (IGR bl2)
Cette séquence qui représente un nouveau membre présente une homologie des nucléotides de 94 % avec PH 16 (Tillinghast, déjà cité), GPPA (Li, déjà cité) et HT45 (Kimura (25)).  This sequence which represents a new member has a homology of the nucleotides of 94% with PH 16 (Tillinghast, already cited), GPPA (Li, already cited) and HT45 (Kimura (25)).
Sous-famille Vβ 12 (Fig. 3) : SEQ ID N° 12 (IGR b13) Vβ 12 subfamily (Fig. 3): SEQ ID N ° 12 (IGR b13)
Cette séquence qui représente un nouveau membre correspond à plus de 85 % d'homologie avec les séquences PH27  This sequence which represents a new member corresponds to more than 85% homology with the PH27 sequences
(Tillinghast, déjà cité) et PL42 (Concannon, déjà cité). Sous-famille Vβ 13 (Fig. 4) : (Tillinghast, already cited) and PL42 (Concannon, already cited). Vβ 13 subfamily (Fig. 4):
SEQ ID N° 13, 14 et 15 (IGR bl4 , IGR bl5 et IGR b16) Les séquences SEQ ID N" 13 et 14 qui représentent de nouveaux membres présentent une homologie respectivement de 78 à 91 % et de 77 à 79 % avec les autres séquences connues SEQ ID N ° 13, 14 and 15 (IGR bl4, IGR bl5 and IGR b16) The sequences SEQ ID N "13 and 14 which represent new members have homology of 78 to 91% and 77 to 79% respectively with the other known sequences
HBVP34 (Kimura (23)) et CEM (Duby (26)).  HBVP34 (Kimura (23)) and CEM (Duby (26)).
La séquence SEQ ID Nº 15 présente une homologie de 94 % avec HBVP34. Il est à noter que la séquence SEQ ID N° 15 présente un intron (représenté en caractères minuscules) dans la région leader. La séquence SEQ ID N° 15 est une séquence consensus. On a observé en position 231 un C au lieu d'un T et en position 259 un A au lieu d'un G. The sequence SEQ ID Nº 15 has a 94% homology with HBVP34. It should be noted that the sequence SEQ ID No. 15 has an intron (represented in lowercase characters) in the leader region. The sequence SEQ ID No. 15 is a consensus sequence. At position 231 we observed a C instead of a T and at position 259 an A instead of a G.
Sous-famille Vβ 7 (Fig. 5) : Vβ 7 subfamily (Fig. 5):
SEQ ID N° 16 et 17 (IGR b17 et IGR b18) SEQ ID N ° 16 and 17 (IGR b17 and IGR b18)
Ces séquences présentent une forte homologie avec la séquence PL4.19 tronquée (Concannon, déjà cité) et la prolongent du côté 5' jusqu'au signal de début de la traduction.  These sequences have a strong homology with the truncated PL4.19 sequence (Concannon, already cited) and extend it on the 5 'side until the signal to start translation.
SEQ ID N° 18 (IGR b19) SEQ ID N ° 18 (IGR b19)
Cette séquence prolonge la séquence PL4.9 (Concannon, déjà cité) du côté 5' jusqu'au signal de début de la  This sequence extends sequence PL4.9 (Concannon, already cited) from the 5 'side until the signal to start the
traduction. translation.
Sous-famille Vβ 9 (Fig. 6) : SEQ ID Nº 19 (IGR b20) Vβ 9 subfamily (Fig. 6): SEQ ID Nº 19 (IGR b20)
Cette séquence prolonge la séquence PL2.6 (Concannon, déjà cité) du côté 5'. On observe une différence entre les deux séquences aux positions 98 et 100 correspondant à des aminoacides différents.  This sequence extends the PL2.6 sequence (Concannon, already cited) on the 5 'side. There is a difference between the two sequences at positions 98 and 100 corresponding to different amino acids.
La présente invention vise également à fournir des oligonucléotides spécifiques des différentes sous-familles Vβ, qui sont utilisables comme amorces pour l'amplification d'ADN correspondant à ces différentes sous-familles Vβ , en vue par exemple d'une étude de l'expression de certaines sous-familles Vβ chez un patient et finalement d'un diagnostic des désordres inmmunitaires, comme indiqué plus haut. The present invention also aims to provide specific oligonucleotides of the different Vβ subfamilies, which can be used as primers for the amplification of DNA. corresponding to these different Vβ subfamilies, with a view for example to a study of the expression of certain Vβ subfamilies in a patient and finally to a diagnosis of immune disorders, as indicated above.
L'expression prédominante de certaines sous-familles de Vβ a déjà été étudiée à l'aide d'une gamme incomplète d'oligonucléotides.  The predominant expression of certain Vβ subfamilies has already been studied using an incomplete range of oligonucleotides.
Ainsi, Sottini et al. (33) ont mis en évidence à l'aide d'une gamme d*oligonucléotides une expression prédominante de certains Vβ chez des patients atteints d'arthrite rhumatoïde.  Thus, Sottini et al. (33) have demonstrated, using a range of oligonucleotides, a predominant expression of certain Vβ in patients with rheumatoid arthritis.
De même, Choi Y. et al (32) ont mis en évidence à l'aide d'une gamme d'oligonucléotides la stimulation de lymphocytes T par des toxines de Staphylococcus aureus par l' intermédiaire de Vβ spécifiques.  Similarly, Choi Y. et al (32) have demonstrated, using a range of oligonucleotides, the stimulation of T lymphocytes by toxins from Staphylococcus aureus via specific Vβ.
La présente invention vise à fournir une gamme complète d*oligonucléotides permettant l'étude à la fois des  The present invention aims to provide a full range of oligonucleotides allowing the study of both
sous-familles Vβ connues et des nouvelles sous- familles Vβ de l'invention et qui soient tout-à-fait spécifiques de chaque sous-famille. Les oligonucléotides ont donc été choisis et synthétisés dans ce but et au besoin des modifications de un ou deux nucléotides ont été introduites par rapport aux  known Vβ subfamilies and new Vβ subfamilies of the invention which are entirely specific to each subfamily. The oligonucleotides were therefore chosen and synthesized for this purpose and, if necessary, modifications of one or two nucleotides were introduced compared to the
séquences naturelles pour réduire les réactivités croisées entre sous-familles.  natural sequences to reduce cross-reactivities between sub-families.
La présente invention a ainsi également pour objet des oligonucléotides, utilisables comme amorces pour l'amplification d'ADN correspondant à des régions variables de chaînes β des récepteurs de cellules T, choisis parmi les séquences SEQ ID N° 25 à 48.  The present invention thus also relates to oligonucleotides, which can be used as primers for the amplification of DNA corresponding to variable regions of β chains of T cell receptors, chosen from the sequences SEQ ID N ° 25 to 48.
La présente invention a également pour objet l'utilisa- tion, comme amorces pour l'amplification d'ADN correspondant à des régions variables de chaînes des récepteurs des cellules T, d'oligonucléotides choisis parmi les séquences SEQ ID N° 25 à 48.  The subject of the present invention is also the use, as primers for the amplification of DNA corresponding to variable regions of chains of T cell receptors, of oligonucleotides chosen from the sequences SEQ ID Nos. 25 to 48.
La présente invention a également pour objet un procédé de détection de séquences nucléotidiques codant pour des segments Vβ des récepteurs T ou d'ADNc correspondant aux produits de transcription de celles-ci, dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend : a) l'amplification de l'ADN avec au moins une paire d'amorces formée par l'un des oligonucléotides définis ci-dessus et un oligonucléotide appartenant au segment Cβ , et The present invention also relates to a method of detecting nucleotide sequences coding for Vβ segments of T receptors or of cDNA corresponding to the transcription products thereof, in a biological sample, characterized in that it comprises: a) amplification of the DNA with at least one pair of primers formed by one of the oligonucleotides defined above and an oligonucleotide belonging to the Cβ segment, and
b) la détection des séquences amplifiées avec une sonde Cβ .  b) the detection of the amplified sequences with a Cβ probe.
L'oligonucléotide appartenant un segment Cβ utilisé pour l'amplification peut être notamment choisi parmi les séquences SEQ ID N° 49 et 50.  The oligonucleotide belonging to a Cβ segment used for the amplification can in particular be chosen from the sequences SEQ ID Nos. 49 and 50.
Pour contrôler l'efficacité de l'amplification, on opère avantageusement en présence d'une paire d'amorces contrôle et on détecte la séquence contrôle correspondante amplifiée à l'aide d'une sonde contrôle correspondante.  To control the efficiency of the amplification, the procedure is advantageously carried out in the presence of a pair of control primers and the corresponding control sequence amplified is detected using a corresponding control probe.
Cette paire d'amorces contrôle peut correspondre à deux segments Cα, par exemple les amorces CαE et CαJ correspondant aux séquences SEQ ID N° 55 et 56. On utilise alors une sonde de détection Cα (correspondant par exemple à la séquence SEQ ID Nº 57). Mais cette paire d'amorces est avantageusement constituée par deux amorces appartenant à la β-actine, notamment celles correspondant aux séquences SEQ ID N° 52 et 53. O utilise alors une sonde de détection correspondant à une séquence de la 0-actine, telle la séquence SEQ ID N° 54.  This pair of control primers can correspond to two Cα segments, for example the primers CαE and CαJ corresponding to the sequences SEQ ID N ° 55 and 56. A Cα detection probe is then used (corresponding for example to the sequence SEQ ID No 57 ). However, this pair of primers is advantageously constituted by two primers belonging to β-actin, in particular those corresponding to sequences SEQ ID No. 52 and 53. O then uses a detection probe corresponding to a sequence of 0-actin, such the sequence SEQ ID N ° 54.
La présente invention a également pour objet un kit de diagnostic pour la mise en oeuvre du procédé précédemment défini, qui comprend :  The present invention also relates to a diagnostic kit for implementing the method defined above, which comprises:
a) au moins un oligonucléotide choisi parmi les séquences SEQ ID N° 25 à 48, a) at least one oligonucleotide chosen from the sequences SEQ ID N ° 25 to 48,
b) une amorce Cβ, b) a Cβ primer,
c) une sonde Cβ . c) a Cβ probe.
Un tel kit contient avantageusement en outre :  Such a kit advantageously also contains:
d) une paire d'amorces contrôle, d) a pair of control primers,
e) une sonde contrôle. e) a control probe.
Ce kit peut notamment comprendre :  This kit can notably include:
a) l'ensemble des 24 oligonucléotides correspondant aux séquences SEQ ID N° 25 à 48, a) all 24 oligonucleotides corresponding to sequences SEQ ID N ° 25 to 48,
b) une amorce Cβ choisie parmi les séquences correspondant au séquences SEQ ID 49 et 50, b) a Cβ primer chosen from the sequences corresponding to the sequences SEQ ID 49 and 50,
c) une paire d'amorces contrôle pour la /3-actine ayant une séquence correspondant respectivement aux séquences SEQ ID N° 52 et 53, d) une sonde Cβ correspondant à la séquence SEQ ID Nº 51, e) une sonde contrôle pour la β-actine correspondant à la séquence SEQ ID N° 54. c) a pair of control primers for / 3-actin having a sequence corresponding respectively to sequences SEQ ID No. 52 and 53, d) a Cβ probe corresponding to the sequence SEQ ID No. 51, e) a control probe for β-actin corresponding to the sequence SEQ ID No. 54.
Dans l'information donnée dans la liste des séquences pour les séquences 25 à 54, les séquences SEQ ID N° 25 à 45 correspondent à des séquences appartenant à des clones des sous-familles connues Vβ 1 à Vβ 20 (accessibles dans la base de données EMBL) ou à des séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides. Les séquences SEQ ID Nº 45, 46, 47 et 48 correspondent à des séquences appartenant à des clones de nouvelles sous-familles de l'invention, correspondent à des sous-familles dénommées provisoirement Vβ w21, Vβ w22, Vβ w23 et Vβ w24 (w indiquant que la désignation est dans l'attente d'une désignation définitive).  In the information given in the list of sequences for sequences 25 to 54, the sequences SEQ ID No. 25 to 45 correspond to sequences belonging to clones of the known subfamilies Vβ 1 to Vβ 20 (accessible in the database of EMBL data) or to sequences which differ by one or two nucleotides. The sequences SEQ ID Nº 45, 46, 47 and 48 correspond to sequences belonging to clones of new subfamilies of the invention, correspond to subfamilies provisionally named Vβ w21, Vβ w22, Vβ w23 and Vβ w24 ( w indicating that the designation is awaiting final designation).
Les séquences SEQ ID N° 49 et 50 sont deux exemples d'oligonucléotides Cβ qui peuvent être utilisés comme amorces pour l'amplification.  The sequences SEQ ID No. 49 and 50 are two examples of Cβ oligonucleotides which can be used as primers for amplification.
La séquence SEQ ID N° 51 est la séquence d'une sonde Cβ qui peut être utilisée pour la détection des ADN amplifiés.  The sequence SEQ ID No. 51 is the sequence of a Cβ probe which can be used for the detection of the amplified DNAs.
Enfin, les séquences SEQ ID N° 52, 53 et 54 sont respectivement les séquences d'une paire d' oligonucléotides appartenant à la séquence de la 0-actine qui peuvent être utilisés pour le contrôle de l'amplification et la séquence d'une sonde pour détecter les ADN amplifiés correspondants.  Finally, the sequences SEQ ID No. 52, 53 and 54 are respectively the sequences of a pair of oligonucleotides belonging to the sequence of 0-actin which can be used for the control of the amplification and the sequence of a probe to detect corresponding amplified DNAs.
Dans la liste des séquences la position indiquée est la position de l'extrémité 5' à compter du site d'initiation prédictif de la traduction ATG. Dans le cas où les séquences sont incomplètes (région 5' inconnue), la position (marquée avec un astérisque) est donnée par rapport au premier nucléotide de la séquence. Les nucléotides soulignés correspondent aux mésappariements introduits par rapport à la séquence naturelle.  In the list of sequences, the position indicated is the position of the 5 ′ end from the predictive initiation site for ATG translation. In the case where the sequences are incomplete (unknown 5 'region), the position (marked with an asterisk) is given relative to the first nucleotide of the sequence. The underlined nucleotides correspond to the mismatches introduced with respect to the natural sequence.
Les oligonucléotides ont été synthétisés sur un synthétiseur d'ADN automatisé Applied Biosystems 381 A en utilisant la méthode au β-cyanoéthylphosphoramidite (Sinha N. et al.  The oligonucleotides were synthesized on an Applied Biosystems 381 A automated DNA synthesizer using the β-cyanoethylphosphoramidite method (Sinha N. et al.
(34)) et en suivant le protocole recommandé par le fabricant. Les oligonucléotides ont été détritylés dans l'appareil, clivés du support et déprotégés par l'ammoniac (à 60° C pendant 5 heures). Les produits bruts ont été purifiés par chromatographie haute pression en phase inversée sur une colonne de μ-bondapak C18 en utilisant un gradient d'acétonitrile (9 à 15 %) dans un tampon acétate de triéthylammonium 0,01 M à pH 5,5. (34)) and following the protocol recommended by the manufacturer. The oligonucleotides were detritylated in the apparatus, cleaved from the support and deprotected with ammonia (at 60 ° C. for 5 hours). The crude products were purified by high-pressure reverse phase chromatography on a column of μ-bondapak C18 using a gradient of acetonitrile (9 to 15%) in a 0.01 M triethylammonium acetate buffer at pH 5.5.
L'amplification effectuée en utilisant les amorces selon l'invention peut être notamment la technique d'amplification par PCR (Polymérase Chain Reaction) telle que décrite par Saiki et al. (14) et brevets US-A-4 683 195, 4 683 202,  The amplification carried out using the primers according to the invention can in particular be the amplification technique by PCR (Polymerase Chain Reaction) as described by Saiki et al. (14) and patents US-A-4,683,195, 4,683,202,
4 889 818.  4,889,818.
Pour la PCR, on peut utiliser un ADN double brin que l'o dénature ou un ADNc obtenu à partir d'ARN à l'aide de réverse transcriptase comme mentionné plus haut.  For the PCR, it is possible to use a double stranded DNA that denatures or a cDNA obtained from RNA using reverse transcriptase as mentioned above.
L'agent de polymérisation est une ADN polymérase, notamment la Taq polymérase.  The polymerization agent is a DNA polymerase, in particular Taq polymerase.
Généralement, le cycle d'amplification est répété 25 à 4 fois.  Generally, the amplification cycle is repeated 25 to 4 times.
Les sondes que l'on utilise pour la détection des  The probes that are used for the detection of
séquences amplifiées peuvent être obtenues par marquage d' oligonucléotides avec un isotope radioactif, ce qui conduit à une détection par autoradiographie, ou par couplage avec un enzyme telle que la peroxydase (système ECL Amersham), la phosphatase alcaline ou la β-galactosidase (système Tropix Ozyme), ce qui conduit à une détection par chimioluminescence.  amplified sequences can be obtained by labeling oligonucleotides with a radioactive isotope, which leads to detection by autoradiography, or by coupling with an enzyme such as peroxidase (ECL Amersham system), alkaline phosphatase or β-galactosidase (system Tropix Ozyme), which leads to chemiluminescence detection.
L'exemple suivant illustre la mise en oeuvre du procédé de détection selon l'invention.  The following example illustrates the implementation of the detection method according to the invention.
Les lymphocytes périphériques d'un individu sain ont été préparés par centrifugation sur un gradient de densité. L'ARN total a été extrait selon la méthode en une seule étape par extraction avec de l'isothiocyanate de guanidium, du phénol e du chloroforme (Chomczynski, 13). L'ADN complémentaire a été synthétisé dans un volume final de 20 μl à 42° C durant 1 heure en utilisant 1 à 5 μg d'ARN total, la réverse transcrip tase et l'amorce Cβ B (1,25 M).  The peripheral lymphocytes of a healthy individual were prepared by centrifugation on a density gradient. Total RNA was extracted according to the one-step method by extraction with guanidium isothiocyanate, phenol and chloroform (Chomczynski, 13). The complementary DNA was synthesized in a final volume of 20 μl at 42 ° C for 1 hour using 1 to 5 μg of total RNA, the reverse transcrip tase and the primer Cβ B (1.25 M).
Le matériel obtenu a ensuite été chauffé à 95° C durant 3 minutes avant d'être soumis à une amplification selon la technique PCR en utilisant en parallèle chacune des amorces Vβ spécifiques correspondant aux séquences SEQ ID Nº 25 à 48 et l'amorce Cβ B spécifique de la région Cβ (SEQ ID N° 50). Cette amplification a été réalisée dans un volume final de 10 μl par tube contenant 50 mM de KCl, 10 mM de tris-HCl pH 8,3, 1,5 mM de MgCl2 0,1 % (poids/ volume) de gélatine, 200 M de dNTP, 0,25 unités de Taq polymérase et 0,25 M de chaque amorce. Dans chaque tube, une amplification contrôle a été réalisée à partir de 25 mM d'un fragment d'ADN de β-actine de 877 paires de bases préparé par PCR et des amorces Act 1 et Act 2 (SEQ ID N° 52 et 53) spécifiques de l'actine. 30 cycles d'amplification ont été effectués suivis d'une étape d'élongation finale de 5 minutes à 72° C. Chaque cycle comprenait une étape de dénaturation à 94° C pendant 1 minute, une étape d'hybridation à 65° C pendant 1 minute et une période d'élongation à 72° C pendant 1 minute. The material obtained was then heated at 95 ° C for 3 minutes before being subjected to an amplification according to the PCR technique using in parallel each of the specific Vβ primers corresponding to the sequences SEQ ID Nº 25 to 48 and the primer Cβ B specific for the Cβ region (SEQ ID No. 50). This amplification was carried out in a final volume of 10 μl per tube containing 50 mM KCl, 10 mM tris-HCl pH 8.3, 1.5 mM MgCl2 0.1% (weight / volume) of gelatin, 200 M of dNTP, 0.25 units of Taq polymerase and 0.25 M of each primer. In each tube, a control amplification was carried out starting from 25 mM of a DNA fragment of β-actin of 877 base pairs prepared by PCR and of the primers Act 1 and Act 2 (SEQ ID N ° 52 and 53 ) specific for actin. 30 amplification cycles were carried out followed by a final elongation step of 5 minutes at 72 ° C. Each cycle included a denaturation step at 94 ° C for 1 minute, a hybridization step at 65 ° C for 1 minute and an elongation period at 72 ° C for 1 minute.
Les produits obtenus ont été séparés par électrophorèse sur un gel d'agarose à 2 %, transférés sur des membranes de nylon dans un tampon alcalin et hybrides simultanément avec les sondes oligonucléotides CβC (SEQ ID N° 51) et Act 3 (SEQ ID N° 54) marquées au 32P par l'enzyme polynucléotidyl T4 kinase. L'hybridation a été réalisée à 42° C pendant 16 heures dans un tampon contenant 6 × SSC, 0,5 % SDS, 5 × Denhart's, 0,05 % PO4H2Na et 100 μg/ml d'ADN de sperme de saumon The products obtained were separated by electrophoresis on a 2% agarose gel, transferred to nylon membranes in an alkaline buffer and hybridized simultaneously with the oligonucleotide probes CβC (SEQ ID No. 51) and Act 3 (SEQ ID N ° 54) labeled with 32 P by the enzyme polynucleotidyl T4 kinase. Hybridization was performed at 42 ° C for 16 hours in a buffer containing 6 × SSC, 0.5% SDS, 5 × Denhart's, 0.05% PO4H2Na and 100 μg / ml of salmon sperm DNA
dénaturé. Les membranes ont ensuite été lavées avec du 6 × SSC, 20mM PO4H2Na, deux fois à température ambiante pendant 5 minutes et une fois à 50° C pendant 30 minutes puis autoradiographiées.  denatured. The membranes were then washed with 6 × SSC, 20mM PO4H2Na, twice at room temperature for 5 minutes and once at 50 ° C for 30 minutes and then autoradiographed.
Les résultats obtenus sont indiqués sur la figure 8.  The results obtained are shown in Figure 8.
Le contrôle d'actine (bande de 877 paires de bases) permet de vérifier l'amplification dans tous les puits. Il apparaît en-dessous de cette bande un signal spécifique dont la taille correspond à la taille des fragments amplifiés corespondants, chaque fragment ayant une longueur correspondant à la distance entre l'emplacement de l'oligonucléotide spécifique Vβ et l'amorce Cβ .  Actin control (band of 877 base pairs) makes it possible to verify the amplification in all the wells. A specific signal appears below this band, the size of which corresponds to the size of the corresponding amplified fragments, each fragment having a length corresponding to the distance between the location of the specific oligonucleotide Vβ and the primer Cβ.
Chez l'individu testé, la Figure 8 met en  In the individual tested, Figure 8 highlights
évidence l'expression préférentielle de certains segments géniques définis par rapport à d'autres. Par exemple, les sous-familles Vβ 1 et 2 sont plus représentées que les autres sous-familles. evidence of the preferential expression of certain defined gene segments over others. For example, the subfamilies Vβ 1 and 2 are more represented than the others subfamilies.
Exemple de préparation d'anticorps monoclonaux anti Vβ13 anticorps monoclonaux RO-73 et JU-74 Example of preparation of monoclonal antibodies against Vβ13 monoclonal antibodies RO-73 and JU-74
1) Cellules immunisantes 1) Immunizing cells
Le clone T 3025 (Moebius et al. (35)) a été cultivé en milieu complet comprenant du DMEM (Seromed), 8 % de sérum humain AB, de l'IL-2 et du TCGF comme décrit par Hercend et al. (36). Des restimulations périodiques ont été effectuées sur cellules allogéniques en présence d'IL-2. Les ARN messagers codant pour le récepteur T exprimés par ces cellules on été séquences par la technique d'A-PCR et représentent des réarrangements des segments géniques VαlO (séquence HAP58, Yoshikai et al. (37)) et Vβ13 (séquence IGRb16=SEQ ID N° 15 indiquée ci-dessus).  Clone T 3025 (Moebius et al. (35)) was cultured in complete medium comprising DMEM (Seromed), 8% human AB serum, IL-2 and TCGF as described by Hercend et al. (36). Periodic restimulations were carried out on allogenic cells in the presence of IL-2. The messenger RNAs encoding the T receptor expressed by these cells have been sequenced by the A-PCR technique and represent rearrangements of the Vα10 (gene HAP58, Yoshikai et al. (37)) and Vβ13 gene segments (IGRb16 = SEQ sequence ID N ° 15 indicated above).
2) Immunisation des souris 2) Immunization of mice
Des souris Biozzi de 6 semaines (Institut Curie, Paris, France) ont été immunisées avec les cellules T entières du clone 3025. Après une première injection intrapéritonéale de × 106 cellules en adjuvant complet de Freund, les souris ont reçu trois injections intrapérito-néales de 5 × 106 cellules en adjuvant incomplet de Freund à trois semaines d'intervalle Deux semaines après la dernière injection intrapéritonéale, les souris ont reçu 2 × 106 cellules viables en injection intraveineuse. Les souris ont été sacrifiées trois jours plus tard et la rate a été prélevée. 3) Fusion 6 week Biozzi mice (Institut Curie, Paris, France) were immunized with the whole T cells of clone 3025. After a first intraperitoneal injection of × 10 6 cells with complete Freund's adjuvant, the mice received three intraperitoneal injections. 5 × 10 6 cells with incomplete Freund's adjuvant three weeks apart Two weeks after the last intraperitoneal injection, the mice received 2 × 10 6 viable cells by intravenous injection. The mice were sacrificed three days later and the spleen was removed. 3) Merger
La fusion des cellules spléniques avec le myélome non sécrétant NS-1 a été menée selon la méthode de Kohler et Milstein (38). Les cellules NS-1 (Kohler et Milstein (39)) on été cultivées en milieu comprenant du DMEM (Seromed), de la 8 azaguanine (Sigma, Saint Louis, MI), 10 % de sérum de cheval (Seromed, lot n° 5Z04), de la pénicilline et de la streptomycine (Eurobio), de la glutamine (Seromed, 200 mM) et du pyruvate de sodium (Gibco, 100 mM). Les spénocytes ont été fusionnés avec les cellules NS-1 par le polyéthylène-glycol (PEG 1000, Merck) avec un rapport de 4 cellules spleniques pour une cellule de myélome. Après l fusion, les cellules ont été cultivées à 3 × 106 cellules par ml en plaques de 96 puits (Nunc) dans un milieu de sélection HAT contenant du DMEM, 10 % de sérum de cheval, 10 % de sérum de veau foetal (Seromed, lot n° 219195), de l'aminoptérine (Gibco), de l'hypoxanthine et de la thymidine (Gibco), de la pénicilline et de la streptomycine, de la glutamine, du pyruvate de sodium et du NCTC 109 (Eurobio). Du milieu frais a ét ajouté dans les puits 2 jours (50 μl par puits) et 9 jours après la fusion (100 μl par puits). La culture a été réalisée à 37° C, dans un incubateur contenant 10 % de CO2. 4) Criblage des hybridomes The fusion of the spleen cells with the NS-1 non-secreting myeloma was carried out according to the method of Kohler and Milstein (38). NS-1 cells (Kohler and Milstein (39)) were cultured in medium comprising DMEM (Seromed), 8 azaguanine (Sigma, Saint Louis, MI), 10% horse serum (Seromed, lot no. 5Z04), penicillin and streptomycin (Eurobio), glutamine (Seromed, 200 mM) and sodium pyruvate (Gibco, 100 mM). The spenocytes were fused with the NS-1 cells by polyethylene glycol (PEG 1000, Merck) with a ratio of 4 splenic cells to a myeloma cell. After fusion, the cells were cultured at 3 × 10 6 cells per ml in 96-well plates (Nunc) in a HAT selection medium containing DMEM, 10% horse serum, 10% fetal calf serum ( Seromed, lot no. 219195), aminopterin (Gibco), hypoxanthine and thymidine (Gibco), penicillin and streptomycin, glutamine, sodium pyruvate and NCTC 109 (Eurobio ). Fresh medium was added to the wells 2 days (50 μl per well) and 9 days after the fusion (100 μl per well). The culture was carried out at 37 ° C., in an incubator containing 10% CO 2 . 4) Screening of hybridomas
Le surnageant des hybridomes obtenus a été récolté 15 jours après la fusion et testé pour sa réacti-vité avec la cellule immunisante par immunofluorescence indirecte et analyse en cytométrie de flux. En bref, les cellules T3025 ont été incubées à 4° C pendant 30 minutes avec le surnageant d'hybridome (100 μl pour 300 000 cellules), lavées et marquées avec un anticorps de chèvre anti-immunoglobulines de souris conjugué à la fluoresceine (Coulter Electronics, Hialeah, FL). Les cellules ont ensuite été analysées par cytofluorométrie (Coulter Profile). Comme le montrent les figures 9A et 10A, les surnageants des hybridomes R0-73 et JU-74 permettent le marquage de 100 % des cellules du clone immunisant 3025. Un anticorps anti-CD3 (OKT3 Ortho-Co) et l'anticorps anti-clonotype NKTa (IgG1, Hercend et al. (40)) servaient respectivement de contrôles positif et négatif dans cette expérience.  The supernatant of the hybridomas obtained was collected 15 days after the fusion and tested for its reactivity with the immunizing cell by indirect immunofluorescence and analysis by flow cytometry. Briefly, the T3025 cells were incubated at 4 ° C. for 30 minutes with the hybridoma supernatant (100 μl per 300,000 cells), washed and labeled with a goat anti-mouse immunoglobulin antibody conjugated to fluorescein (Coulter Electronics, Hialeah, FL). The cells were then analyzed by cytofluorometry (Coulter Profile). As shown in FIGS. 9A and 10A, the supernatants of the hybridomas R0-73 and JU-74 allow the labeling of 100% of the cells of the immunizing clone 3025. An anti-CD3 antibody (OKT3 Ortho-Co) and the anti- NKTa clonotype (IgG1, Hercend et al. (40)) served as positive and negative controls respectively in this experiment.
5) Spécificité anti-récepteur T 5) Specificity anti-T receptor
La spécificité anti-récepteur T des anticorps monoclonaux a été analysée selon les critères suivants :  The anti-T receptor specificity of the monoclonal antibodies was analyzed according to the following criteria:
1 - les anticorps doivent reconnaître le clone T 3025 immunisant mais pas un clone T portant un récepteur des cellules T (TCR) différent, par exemple le clone 12410  1 - the antibodies must recognize the immunizing T clone 3025 but not a T clone carrying a different T cell receptor (TCR), for example clone 12410
(Moebius et al., (35), TCR exprimé : Va3/Vβ17 ) . 2 - Les anticorps doivent réagir avec un faible pourcentage de lymphocytes circulants (PBL). (Moebius et al., (35), TCR expressed: Va3 / Vβ17). 2 - The antibodies must react with a small percentage of circulating lymphocytes (PBL).
3 - La structure de surface reconnue par les anticorps sur la cellule immunisante doit co-moduler avec la molécule CD3 lors de l'incubation des cellules en présence d'anticorps anti-CD3 (Meuer et al. (1)).  3 - The surface structure recognized by the antibodies on the immunizing cell must co-modulate with the CD3 molecule during the incubation of the cells in the presence of anti-CD3 antibodies (Meuer et al. (1)).
Comme le montrent les figures 9 et 10, les surnageants des hybridomes RO-73 et JU-74 réagissent avec 100 % des cellules du clone 3025 immunisant (Fig. 9A et 10A), moins de % des cellules du clone 12410 (Fig. 9B et 10B) et 1 à 3 % des PBL (Fig. 9C et 10C).  As shown in FIGS. 9 and 10, the supernatants of the RO-73 and JU-74 hybridomas react with 100% of the cells of the immunizing clone 3025 (FIG. 9A and 10A), less than% of the cells of clone 12410 (FIG. 9B and 10B) and 1 to 3% of the PBL (Fig. 9C and 10C).
Pour les expériences de co-modulation, les cellules du clone 3025 (106 cellules par ml) ont été incubées en milieu seul ou en présence d'anticorps anti-CD3 (OKT3) dans des plaques de culture de 24 puits. Après 24 heures d'incubation, les cellules ont été récoltées et marquées avec le surnageant d'hybridome RO-73 ou JU-74, l'anticorps monoclonal anti-CD3 ou un anticorps monoclonal contrôle anti-CD2 (Coultronics Co.) puis analysées par cytofluorimétrie. Comme le montrent les Figures 11 et 12, l'analyse par cytofluorimétrie des cellules incubées en présence d'anticorps monoclonal anti-CD3 (Fig. 11B et 12B) montre une diminution de l'intensité de fluorescence pour l'anticorps monoclonal anti-CD3 ainsi que pour RO-73 et JU-74, alors que l'intensité du marquage avec l'anticorps monoclonal anti-CD2 augmente par comparaison à l'intensité obtenue respectivement en absence d'anticorps anti-CD3 (Fig. 11A et Fig. 11B). Ces résultats indiquent que la molécule reconnue par les anticorps RO-73 et JU-74 co-module avec la molécule CD3 à la surface des cellules du clone T 3025. For the co-modulation experiments, the cells of clone 3025 (10 6 cells per ml) were incubated in medium alone or in the presence of anti-CD3 antibody (OKT3) in 24-well culture plates. After 24 hours of incubation, the cells were harvested and labeled with the hybridoma supernatant RO-73 or JU-74, the anti-CD3 monoclonal antibody or a anti-CD2 control monoclonal antibody (Coultronics Co.) and then analyzed. by cytofluorimetry. As shown in FIGS. 11 and 12, the cytofluorimetry analysis of the cells incubated in the presence of anti-CD3 monoclonal antibody (FIGS. 11B and 12B) shows a decrease in the fluorescence intensity for the anti-CD3 monoclonal antibody as well as for RO-73 and JU-74, while the intensity of labeling with the anti-CD2 monoclonal antibody increases in comparison with the intensity obtained respectively in the absence of anti-CD3 antibody (FIG. 11A and FIG. 11B). These results indicate that the molecule recognized by the antibodies RO-73 and JU-74 co-modulates with the molecule CD3 on the surface of the cells of the clone T 3025.
6) Isolement d'un sous-clone 6) Isolation of a subclone
Les cellules des hybridomes initiaux, respectivement RO-73 et JU-74, ont été réparties en plaques de culture à raison de 0,5 cellule par puits en milieu HAT complet, sur des cellules spleniques syngeniques irradiées. 3 sous-clones ont été sélectionnés pour chacun des hybridomes RO-73 et JU-74. Ces cellules produisent des anticorps monoclonaux dont la réactivité est identique à celle des hybridomes initiaux (résultats non montrés). The cells of the initial hybridomas, respectively RO-73 and JU-74, were distributed in culture plates at the rate of 0.5 cell per well in complete HAT medium, on irradiated syngenic splenic cells. 3 subclones were selected for each of the RO-73 and JU-74 hybridomas. These cells produce monoclonal antibodies whose reactivity is identical to that of the initial hybridomas (results not shown).
Les sous-clones ont été cultivés en milieu non sélectif contenant du DMEM, 10 % de sérum de veau foetal, 10 % de sérum de cheval, de l'hypoxanthine, de la thymidine, de la pénicilline et de la streptomycine, de la glutamine, du pyruvate de sodium et du NCTC 109.  The subclones were cultured in a non-selective medium containing DMEM, 10% fetal calf serum, 10% horse serum, hypoxanthine, thymidine, penicillin and streptomycin, glutamine , sodium pyruvate and NCTC 109.
Les cellules d'hybridomes ou de sous-clones ont été congelées dans du sérum de veau foetal contenant 10 % de diméthyl-suifoxyde (DMSO, Merck) et conservées dans l'azote liquide.  The hybridoma or subclone cells were frozen in fetal calf serum containing 10% dimethyl sulfoxide (DMSO, Merck) and stored in liquid nitrogen.
7) Isotypage des anticorps monoclonaux 7) Isotyping of monoclonal antibodies
Les isotypes ont été déterminés par immunodiffusion sur support solide en utilisant un kit "INNO-LIA mouse mAb  The isotypes were determined by immunodiffusion on solid support using an "INNO-LIA mouse mAb kit.
isotyping" (Innogenetics) pour la détermination des isotypes d'immunoglobulines dans les surnageants de culture. RO-73 et JU-74 sont des immunoglobulines de souris d' isotype IgGl, kappa. 8) Purification des anticorps monoclonaux  isotyping "(Innogenetics) for the determination of immunoglobulin isotypes in culture supernatants. RO-73 and JU-74 are mouse immunoglobulins of isotype IgGl, kappa. 8) Purification of monoclonal antibodies
Des ascites ont été produites dans des souris nudes. Le liquide d'ascite obtenu a été filtré sur coton pour éliminer la fibrine et précipité par le sulfate de sodium (18 %). Le culot obtenu a été mis en suspension dans du tampon PBS, dilué 1/3 dans du tampon (NaCl 4,5 M, glycine 2,25 M, pH 8,8) et chargé sur une colonne de Protéine A-Sepharose 4 Fast Flow équilibrée dans le tampon de charge (NaCl 3M, glycine 1,5 M, pH 8,8). Un pic majoritaire d'immunoglobulines a été élue à pH 6 en utilisant des tampons d'élution successifs de pH décroissant. Ce pic majoritaire a été purifié sur colonne échangeuse d'ions (Q Sepharose Fast Flow) en tampon Tris 50 mM, pH 8 et élue par un gradient de NaCl.  Ascites have been produced in nude mice. The ascites liquid obtained was filtered through cotton to remove the fibrin and precipitated by sodium sulfate (18%). The pellet obtained was suspended in PBS buffer, diluted 1/3 in buffer (4.5 M NaCl, 2.25 M glycine, pH 8.8) and loaded onto a column of Protein A-Sepharose 4 Fast Balanced flow in the loading buffer (3M NaCl, 1.5 M glycine, pH 8.8). A majority peak of immunoglobulins was eluted at pH 6 using successive elution buffers of decreasing pH. This majority peak was purified on an ion exchange column (Q Sepharose Fast Flow) in 50 mM Tris buffer, pH 8 and eluted with a NaCl gradient.
La pureté de la préparation a été vérifiée par électrophorèse dans un système PHAST (Pharmacia LKB, Uppsala, Suède) et les immunoglobulines purifiées ont été testées en immunofluorescence indirecte sur la cellule 3025, comme indiqué précédemment.  The purity of the preparation was checked by electrophoresis in a PHAST system (Pharmacia LKB, Uppsala, Sweden) and the purified immunoglobulins were tested by indirect immunofluorescence on cell 3025, as indicated previously.
A titre d'exemple, pour 30 ml d'ascite de l'hybridome RO- 73, on obtient après purification sur Protéine A et Q For example, for 30 ml of ascites of the hybridoma RO- 73, after purification on Protein A and Q,
Sepharose Fast Flow, 32 mg d'immunoglobulines purifiées.  Sepharose Fast Flow, 32 mg of purified immunoglobulins.
9) Pourcentage de PBL reconnus par les anticorps monoclonaux 9) Percentage of PBL recognized by monoclonal antibodies
Les pourcentages de lymphocytes circulants reconnus respectivement par les anticorps monoclonaux RO-73 et JU-74 ont été déterminés pour 10 donneurs sains différents. Les résultats sont montrés dans le Tableau 1. L'anticorps monocl nal JU-74 reconnaît moins de 0,5 % à 2,1 % des PBL (moyenne 1,08 %) et l'anticorps monoclonal RO-73 reconnaît de 0,5 % à 2,2 % des PBL selon les individus (moyenne 1,09 %). Pour un individu donné, les anticorps monoclonaux RO-73 et JU-74 reconnaissent respectivement environ les mêmes pourcentages lymphocytes circulants. The percentages of circulating lymphocytes recognized respectively by the RO-73 and JU-74 monoclonal antibodies were determined for 10 different healthy donors. The results are shown in Table 1. The monoclonal antibody JU-74 recognizes less than 0.5% to 2.1% of the PBLs (average 1.08%) and the monoclonal antibody RO-73 recognizes from 0, 5% to 2.2% of PBL depending on the individual (average 1.09%). For a given individual, the RO-73 and JU-74 monoclonal antibodies recognize approximately the same percentages of circulating lymphocytes, respectively.
10) Purification des PBL reconnus par les anticorps monoclonaux 10) Purification of PBLs Recognized by Monoclonal Antibodies
Les PBL reconnus respectivement par les anticorps monoclonaux RO-73 et JU-74 ont été purifiés à partir d'un donneur normal en utilisant un procédé de sélection positive par des billes magnétiques (Dynabeads, Dynal). En bref, 1 à 4 × 109 PBL ont été marqués par l'un ou l'autre des anticorps monoclo- naux purifiés ci-dessus et incubés avec les billes Dynabeads M-450 prêtes à l'emploi recouvertes par un sérum de chèvre anti-IgG de souris, dans la proportion de 3 billes pour une cellule marquée. Les cellules positives ont ensuite été séparées grâce à un aimant. Après plusieurs lavages, les cellules ont été incubées avec un excès d'immunoglobulines de chèvre anti-IgG de souris ("Detach-a-beads", Dynatech) pour détacher les billes magnétiques puis directement analysées en cytométrie de flux après marquage par l'anticorps monoclonal RO-73 ou l'anticorps monoclonal JU-74, respectivement. The PBLs recognized respectively by the RO-73 and JU-74 monoclonal antibodies were purified from a normal donor using a positive selection process using magnetic beads (Dynabeads, Dynal). Briefly, 1 to 4 × 10 9 PBLs were labeled with one or other of the above purified monoclonal antibodies and incubated with the ready-to-use Dynabeads M-450 beads covered with goat serum anti-mouse IgG, in the proportion of 3 beads for a labeled cell. The positive cells were then separated using a magnet. After several washes, the cells were incubated with an excess of anti-mouse IgG goat immunoglobulins ("Detach-a-beads", Dynatech) to detach the magnetic beads and then directly analyzed by flow cytometry after labeling with the monoclonal antibody RO-73 or monoclonal antibody JU-74, respectively.
Les cellules positives sélectionnées ont été cultivées e microplaque en présence d'IL-2 sur des cellules allogéniques irradiées puis à nouveau purifiées par les billes magnétiques après environ une semaine de culture afin d'obtenir une prépa- ration d'une pureté supérieure à 95 %.  The selected positive cells were cultured in a microplate in the presence of IL-2 on irradiated allogenic cells and then again purified by magnetic beads after approximately one week of culture in order to obtain a preparation of purity greater than 95 %.
Pour l'anticorps monoclonal JU-74, 8 × 106 cellules positives à 96 % de pureté ont été obtenues, après une culture d'une semaine, à partir de 1 × 109 PBL d'un donneur sain contenant initialement 1,7 % de cellules JU-74+. For the monoclonal antibody JU-74, 8 × 10 6 positive cells with 96% purity were obtained, after a culture for one week, from 1 × 10 9 PBL from a healthy donor initially containing 1.7 % of JU-74 + cells.
Pour l'anticorps monoclonal RO-73, 9 × 106 cellules positives à 98 % de pureté ont été obtenues, après 10 jours de culture, à partir de 1,2 × 109 PBL d'un donneur sain contenant initialement 2,4 % de cellules RO-73+. For the monoclonal antibody RO-73, 9 × 10 6 positive cells with 98% purity were obtained, after 10 days of culture, from 1.2 × 10 9 PBL from a healthy donor initially containing 2.4 % of RO-73 + cells.
A partir des cellules RO-73+ et JU-74+ purifiées ainsi sélectionnées, des lignées cellulaires ont été respectivement établies; chaque lignée est reconnue à 100 % par les deux anticorps monoclonaux, ce qui montre que les deux anticorps monoclonaux reconnaissent les mêmes cellules dans le sang périphérique. 11) Analyse des transcrits du TCR exprimés dans les PBL reconnus par RO-73 et JU-74 par les techniques de PCR From the purified RO-73 + and JU-74 + cells thus selected, cell lines were respectively established; each line is recognized 100% by the two monoclonal antibodies, which shows that the two monoclonal antibodies recognize the same cells in the peripheral blood. 11) Analysis of TCR transcripts expressed in PBLs recognized by RO-73 and JU-74 by PCR techniques
a) Méthode d'analyse des transcrits β  a) Method of analysis of β transcripts
La gamme des oligonucléotides spécifiques des segments de type Vβ1 à Vβ24 décrite ci-dessus (SEQ ID Nº 25 à Nº 48) a été utilisée comme amorces spécifiques pour analyser les transcrits β du TCR exprimés dans les cellules RO-73+ et JU- 74+. La procédure employée est identique à celle décrite dans l'exemple ci-dessus pour les lymphocytes périphériques d'un individu sain. En bref, après préparation de l'ARN selon la méthode de Chomczynski (13), l'ADN complémentaire a été synthétisé en utilisant la réverse transcriptase et l'amorce Cβ (SEQ ID Nº 50). Le matériel obtenu a été soumis à 30 cycles d'amplification selon la technique PCR en utilisant en parallèle chacune des amorces Vβ spécifiques correspondant aux séquences SEQ ID N° 25 à 48 et l'amorce Cβ B spécifique de la région Cβ (SEQ ID Nº 50) comme décrit précédemment.  The range of oligonucleotides specific for the Vβ1 to Vβ24 type segments described above (SEQ ID No 25 to No 48) was used as specific primers to analyze the β TCR transcripts expressed in RO-73 + and JU-74 cells +. The procedure used is identical to that described in the example above for the peripheral lymphocytes of a healthy individual. In short, after preparation of the RNA according to the method of Chomczynski (13), the complementary DNA was synthesized using the reverse transcriptase and the primer Cβ (SEQ ID No. 50). The material obtained was subjected to 30 amplification cycles according to the PCR technique using in parallel each of the specific Vβ primers corresponding to the sequences SEQ ID N ° 25 to 48 and the primer Cβ B specific for the Cβ region (SEQ ID No 50) as described above.
Les produits amplifiés obtenus ont été séparés par électrophorèse sur un gel d'agarose à 2 %, transférés sur des membranes de nylon et hybrides avec la sonde oligonucléotidique Cβ C (SEQ ID Nº 51) marquée au 32P. Les membranes ont ensuite été lavées comme décrit ci-dessus puis autoradiographiées. The amplified products obtained were separated by electrophoresis on a 2% agarose gel, transferred to nylon membranes and hybridized with the Cβ C oligonucleotide probe (SEQ ID No. 51) labeled with 32 P. The membranes were then washed as described above and then autoradiographed.
Le séquençage des transcrits de la chaîne β des TCR a ét réalisé en suivant la méthode de clonage et de séquençage décrite précédemment pour l'ADNc. Par exemple, le matériel amplifié par l'oligonucléotide spécifique de la sous-famille Vβl3 (SEQ ID Nº 37) a été digéré par l'enzyme SacII et purifi par électrophorèse sur gel d'agarose. Le matériel obtenu a ét introduit dans le vecteur pBS SK+ [comme décrit plus haut pou la technique d'A-PCR] et utilisé pour transfecter les bactéries E. Coli XL-1-blue. Les colonies transformées obtenues on été testées par hybridation en dot-blot en utilisant la sonde oligonucléotidique Cβ C (SEQ ID N° 51) marquée au 32P. L'ADN plasmidique a été séquence comme décrit précédemment. b) Méthode d'analyse des transcrits α  The sequencing of the transcripts of the β chain of the TCRs was carried out by following the cloning and sequencing method described above for the cDNA. For example, the material amplified by the specific oligonucleotide of the Vβ13 subfamily (SEQ ID No. 37) was digested with the enzyme SacII and purified by electrophoresis on agarose gel. The material obtained was introduced into the vector pBS SK + [as described above for the A-PCR technique] and used to transfect the E. Coli XL-1-blue bacteria. The transformed colonies obtained were tested by dot-blot hybridization using the oligonucleotide probe Cβ C (SEQ ID No. 51) labeled with 32P. The plasmid DNA was sequenced as previously described. b) Method for analyzing α transcripts
Une méthodologie semblable à celle décrite pour les transcrits β a été appliquée à l'analyse des transcrits de la chaîne α du TCR en utilisant comme amorces spécifiques une gamme d'oligonucléotides spécifiques des segments Va de type Val à Vα29 et des oligonucléotides spécifiques de la région constante Cα (oligonucléotide Cα B pour la synthèse de l'ADN complémentaire et l'amplification par PCR et oligonucléotide Cα C pour la sonde de détection). Les séquences de ces oligonucléotides sont indiquées dans le Tableau 2. A methodology similar to that described for β transcripts has been applied to the analysis of transcripts of the TCR α chain using as specific primers a range of oligonucleotides specific for Val type Va to Vα29 segments and oligonucleotides specific for the Cα constant region (C oligonucleotide B the synthesis of complementary DNA and the amplification by PCR and oligonucleotide Cα C for the detection probe). The sequences of these oligonucleotides are shown in Table 2.
c) Résultats c) Results
La Figure 13 montre les résultats obtenus pour l'analyse des transcrits des chaînes α (Fig. 13 A) et des chaînes β (Fig. 13B) du TCR exprimés par les cellules RO-73+ reconnues par l'anticorps monoclonal RO-73. On constate que de nombreux segments Va différents sont exprimés dans ces cellules (Figur 13A). Par contre, seul l'oligonucléotide spécifique des séquences de la sous-famille Vβ13 permet une amplification de l'ADNc (Figure 13B).  Figure 13 shows the results obtained for the analysis of the transcripts of the α chains (Fig. 13 A) and the β chains (Fig. 13B) of the TCR expressed by the RO-73 + cells recognized by the monoclonal antibody RO-73 . It can be seen that many different Va segments are expressed in these cells (FIG. 13A). On the other hand, only the oligonucleotide specific for the sequences of the Vβ13 subfamily allows amplification of the cDNA (FIG. 13B).
Des résultats identiques ont été obtenus pour les  Identical results were obtained for
transcrits β du TCR exprimés dans les cellules JU-74+ reconnues par l'anticorps monoclonal JU-74 (résultats non montrés). β TCR transcripts expressed in JU-74 + cells recognized by the JU-74 monoclonal antibody (results not shown).
De plus, les transcrits β qui correspondent à la sous-famille Vβ13 exprimés par les cellules JU-74+ ont été  In addition, the β transcripts which correspond to the Vβ13 subfamily expressed by the JU-74 + cells were
séquences à partir des cellules isolées précédemment afin de déterminer, parmi les 5 membres connus ou nouveaux de la sous-famille Vβ13 (Figure 4), ceux dont les produits sont reconnus par l'anticorps monoclonal JU-74. Le tableau 3 montre les résultats obtenus après analyse de ces séquences. Les huit séquences différentes de Vβ13 obtenues correspondent toutes à un réarrangement du segment génique nouveau V/313 IGRbl6 (SEQ ID Nº 15) avec des segments J et des régions N différents. sequences from cells previously isolated in order to determine, among the 5 known or new members of the Vβ13 subfamily (Figure 4), those whose products are recognized by the monoclonal antibody JU-74. Table 3 shows the results obtained after analysis of these sequences. The eight different Vβ13 sequences obtained all correspond to a rearrangement of the new V / 313 IGRbl6 gene segment (SEQ ID No. 15) with different J segments and N regions.
L'ensemble de ces résultats montre que les anticorps monoclonaux RO-73 et JU-74 sont spécifiques des produits de segments géniques appartenant à la sous-famille V/313.  All of these results show that the monoclonal antibodies RO-73 and JU-74 are specific for the products of gene segments belonging to the subfamily V / 313.
Plus précisément, les anticorps monoclonaux JU-74 et RO-73 ont la même spécificité et reconnaissent exclusivement le produit du segment génique nouveau V/313 IGRbl6 de l'invention (SEQ ID N° 15 indiquée ci-dessus).  More specifically, the monoclonal antibodies JU-74 and RO-73 have the same specificity and exclusively recognize the product of the new V / 313 IGRbl6 gene segment of the invention (SEQ ID No. 15 indicated above).
Les lignées cellulaires hybridomes suivantes ont été déposées auprès de la Collection Nationale de Culture de Microorganismes (CNCM - Institut Pasteur) : JU-74 et RO-73 le 12 février 1992 sous les numéros 1-1173 et 1-1172 . The following hybridoma cell lines have been deposited with the National Collection of Culture of Microorganisms (CNCM - Institut Pasteur): JU-74 and RO-73 on February 12, 1992 under the numbers 1-1173 and 1-1172.
REFERENCES : REFERENCES :
1. Meuer, S.C., et al., J. Exp. Med. 1983. 157:705. 1. Meuer, S.C., et al., J. Exp. Med. 1983. 157: 705.
2. Moingeon, P., et al., Nature 1986a. 323:638. 2. Moingeon, P., et al., Nature 1986a. 323: 638.
3. Brenner, M.B., et al.. Nature 1986. 322:145.  3. Brenner, M.B., et al .. Nature 1986. 322: 145.
4. Bank, I., et al., Nature 1986. 322:179.  4. Bank, I., et al., Nature 1986. 322: 179.
5. Davis, M.M., et al., Nature 1988.334:395.  5. Davis, M.M., et al., Nature 1988.334: 395.
6. Crews, S., et al., Cell 1981. 25:59.  6. Crews, S., et al., Cell 1981. 25:59.
7. Wilson, R.K., et al., Immunological Reviews 1988c.  7. Wilson, R.K., et al., Immunological Reviews 1988c.
101:149.  101: 149.
8. Robinson, M.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989.  8. Robinson, M.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989.
86:9422.  86: 9422.
9. Leiden, J.M., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA  9. Leiden, J.M., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
1986. 83:4456.  1986. 83: 4456.
10. Reynolds 1986.  10. Reynolds 1986.
11. Li, Y., et al., J. Exp. Med. 1990. 171:221.  11. Li, Y., et al., J. Exp. Med. 1990. 171: 221.
12. Chirgwin, J.M., et al., Biochemistry 1979. 18:5294 12. Chirgwin, J.M., et al., Biochemistry 1979. 18: 5294
13. Chomczynski et al., Anal. Biochem., 1987, 162, 156.13. Chomczynski et al., Anal. Biochem., 1987, 162, 156.
14. Saiki, R.K., et al., Science 1988. 239:487. 14. Saiki, R.K., et al., Science 1988. 239: 487.
15. Loh, E.Y., et al., Science 1989. 243:217.  15. Loh, E.Y., et al., Science 1989. 243: 217.
16. Sanger, F., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA  16. Sanger, F., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
1977. 74:5463.  1977. 74: 5463.
17. Lipman, D.J., et al., Science 1985. 227:1435.  17. Lipman, D.J., et al., Science 1985. 227: 1435.
18. Kozak, M., Nucl. Acids Res. 1984. 12:857.  18. Kozak, M., Nucl. Acids Res. 1984. 12: 857.
19. Kyte, J., et al., R.F., J. Mol. Biol. 1982. 157:105. 20. Triebel, F., et al., J. Immun. 1988. 140:300.  19. Kyte, J., et al., R.F., J. Mol. Biol. 1982. 157: 105. 20. Triebel, F., et al., J. Immun. 1988. 140: 300.
21. Feinberg, A.P., et al., Anal. Biochem. 1983. 132:6. 21. Feinberg, A.P., et al., Anal. Biochem. 1983. 132: 6.
22. Tillinghast, J.P., et al., Science 1986. 248:879.22. Tillinghast, J.P., et al., Science 1986. 248: 879.
23. Kimura, N., et al., J. Exp. Med. 1986. 164:739. 23. Kimura, N., et al., J. Exp. Med. 1986. 164: 739.
24. Concannon, P., et al., Proc.  24. Concannon, P., et al., Proc.
25. Kimura, N., et al., Eur. J. Immunol. 1987. 17:37525. Kimura, N., et al., Eur. J. Immunol. 1987. 17: 375
26. Duby, A.D., et al., proc. natl. Acad. Se. USA 26. Duby, A.D., et al., Proc. natl. Acad. Se. USA
1986. 83:4890.  1986. 83: 4890.
27. Naudenbark A., et al., Nature, 341, 541.  27. Naudenbark A., et al., Nature, 341, 541.
28. Janeway C., Nature, 341, 482.  28. Janeway C., Nature, 341, 482.
29. Lin Y., J. Exp. Med., 171, 221. 29. Lin Y., J. Exp. Med., 171, 221.
30. Acha-Orbea H., EMBO, 1990, 9,12, 3815.  30. Acha-Orbea H., EMBO, 1990, 9,12, 3815.
31. Kappler J., Science, 244, 811.  31. Kappler J., Science, 244, 811.
32. Choi Y., PNAS, 86, 8941. 33. Sottini A. et al., Eur. J. Immunol., 1991, 21, 32. Choi Y., PNAS, 86, 8941. 33. Sottini A. et al., Eur. J. Immunol., 1991, 21,
461.  461.
34. Sinha N. et al., Nucleic. Acids Res. 1984, 12,  34. Sinha N. et al., Nucleic. Acids Res. 1984, 12,
4539.  4539.
35. Moebius, U. et al., Eur. J. immunol. 1990, 20, 889.35. Moebius, U. et al., Eur. J. immunol. 1990, 20, 889.
36. Hercend, T. et al., Cellular Immunol., 1984, 86, 381.36. Hercend, T. et al., Cellular Immunol., 1984, 86, 381.
37. Yoshikai, Y. et al., J. Exp. med., 1986, 164. 90. 37. Yoshikai, Y. et al., J. Exp. med., 1986, 164. 90.
38. Kohler, G. et Milstein, C., Nature, 1975, 256, 495. 38. Kohler, G. and Milstein, C., Nature, 1975, 256, 495.
39. Kohler, G. et Milstein, C., Eur. J. immunol., 1976, 6 , 511. 39. Kohler, G. and Milstein, C., Eur. J. immunol., 1976, 6, 511.
40. Hercend, T. et al., J. Exp. Med., 158., 1983, 1547.  40. Hercend, T. et al., J. Exp. Med., 158., 1983, 1547.
41. Wilson, R.K. et al., Immunogenetics, 1990, 32, 406. 41. Wilson, RK et al., Immunogenetics, 1990, 32, 406.
LISTE DES SEQUENCES LIST OF SEQUENCES
INFORMATION GENERALE GENERAL INFORMATION
(1) DEMANDEUR : Société dite ROUSSEL UCLAF (1) APPLICANT: Company called ROUSSEL UCLAF
(2) TITRE DE L'INVENTION : Séquences nucléotidiques codant pour des régions variables des chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains, segments peptidiques correspondants et les applications diagnostiques et thérapeutiques. (2) TITLE OF THE INVENTION: Nucleotide sequences coding for variable regions of the β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding peptide segments and diagnostic and therapeutic applications.
(3) NOMBRE DE SEQUENCES : 56 (3) NUMBER OF SEQUENCES: 56
III - INFORMATION POUR SEQ ID Nº 2 III - INFORMATION FOR SEQ ID Nº 2
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 387 paires de bases  LENGTH: 387 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L'ADN : IGR b 02 DNA NAME: IGR b 02
SEQUENCE V/3 W21  SEQUENCE V / 3 W21
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AGTGACCCTG ATCTGGCAAA GCTTCCATCC TGCCCTGACC CTGCC ATG 48 AGTGACCCTG ATCTGGCAAA GCTTCCATCC TGCCCTGACC CTGCC ATG 48
MET  MET
1  1
GGT ACC AGG CTC CTC TGC CGG GTG GCC TTC TGT CTC CTG GTG GAA GAA 96 Gly Thr Arg Leu Leu Cys Arg Val Ala Phe Cys Leu Leu Val Glu Glu  GGT ACC AGG CTC CTC TGC CGG GTG GCC TTC TGT CTC CTG GTG GAA GAA 96 Gly Thr Arg Leu Leu Cys Arg Val Ala Phe Cys Leu Leu Val Glu Glu
5 10 15  5 10 15
CTC ATA GAA GCT GGA GTG GTT CAG TCT CCC AGA TAT AAG ATT ATA GAG 144 Leu Ile Glu Ala Gly Val Val Gln Ser Pro Arg Tyr Lys Ile Ile Glu  CTC ATA GAA GCT GGA GTG GTT CAG TCT CCC AGA TAT AAG ATT ATA GAG 144 Leu Ile Glu Ala Gly Val Val Gln Ser Pro Arg Tyr Lys Ile Glu Island
20 25 30  20 25 30
AAA AAG CAG CCT GTG GCT TTT TGG TGC AAT CCT ATT TCT GGC CAC AAT 192 Lys Lys Gln Pro Val Ala Phe Trp Cys Asn Pro Ile Ser Gly His Asn  AAA AAG CAG CCT GTG GCT TTT TGG TGC AAT CCT ATT TCT GGC CAC AAT 192 Lys Lys Gln Pro Val Ala Phe Trp Cys Asn Pro Ile Ser Gly His Asn
35 40 45  35 40 45
ACC CTT TAC TGG TAC CGG CAG AAC TTG GGA CAG GGC CCG GAG CTT CTG 240 Thr Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Asn Leu Gly Gln Gly Pro Glu Leu Leu 50 55 60 65 ACC CTT TAC TGG TAC CGG CAG AAC TTG GGA CAG GGC CCG GAG CTT CTG 240 Thr Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Asn Leu Gly Gln Gly Pro Glu Leu Leu 50 55 60 65
ATT CGA TAT GAG AAT GAG GAA GCA GTA GAC GAT TCA CAG TTG CCT AAG 288 Ile Arg Tyr Glu Asn Glu Glu Ala Val Asp Asp Ser Gln Leu Pro Lys ATT CGA TAT GAG AAT GAG GAA GCA GTA GAC GAT TCA CAG TTG CCT AAG 288 Ile Arg Tyr Glu Asn Glu Glu Ala Val Asp Asp Ser Gln Leu Pro Lys
70 75 80  70 75 80
GAT CGA TTT TCT GCA GAG AGG CTC AAA GGA GTA GAC TCC ACT CTC AAG 336 Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Leu Lys Gly Val Asp Ser Thr Leu Lys  GAT CGA TTT TCT GCA GAG AGG CTC AAA GGA GTA GAC TCC ACT CTC AAG 336 Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Leu Lys Gly Val Asp Ser Thr Leu Lys
85 90 95  85 90 95
ATC CAG CCT GCA GAG CTT GGG GAC TCG GCC GTG TAT CTC TGT GCC AGC 384 Ile Gln Pro Al_ Glu Leu Gly Asp ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser  ATC CAG CCT GCA GAG CTT GGG GAC TCG GCC GTG TAT CTC TGT GCC AGC 384 Ile Gln Pro Al_ Glu Leu Gly Asp ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser
100 105 110  100 105 110
AGC 387 Ser IV - INFORMATION POUR SEQ ID Nº 3 AGC 387 Ser IV - INFORMATION FOR SEQ ID Nº 3
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 395 paires de bases  LENGTH: 395 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
SEQUENCE CONSENSUS CONSENSUS SEQUENCE
ORIGINEORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES NOM DE L'ADN : IGR b 03  CELL LINE: human T cells CHARACTERISTICS DNA NAME: IGR b 03
SEQUENCE Vβ w22  SEQUENCE Vβ w22
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
ACASGACCAG ATGCCTGAGC TAGGAAAGGC CTCATTCCTG CTGTGATC 48 ACASGACCAG ATGCCTGAGC TAGGAAAGGC CTCATTCCTG CTGTGATC 48
CTGCC ATG GAT ACC TGG CTC GTA TGC TGG GCA ATT TTT AGT CTC TTG 95CTGCC ATG GAT ACC TGG CTC GTA TGC TGG GCA ATT TTT AGT CTC TTG 95
Met Asp Thr Trp Leu Val Cys Trp Ala Ile Phe So r Lou Lou 1 5 10 Met Asp Thr Trp Leu Val Cys Trp Ala Ile Phe So r Lou Lou 1 5 10
AAA GCA GGA CTC ACA GAA CCT GAA GTC ACC CAG ACT CCC AGC CAT CAG 143 Lys Ala Gly Leu Thr Glu Pro Glu Val Thr Gln Thr Pro Ser His Gln 15 20 25 30  AAA GCA GGA CTC ACA GAA CCT GAA GTC ACC CAG ACT CCC AGC CAT CAG 143 Lys Ala Gly Leu Thr Glu Pro Glu Val Thr Gln Thr Pro Ser His Gln 15 20 25 30
GTC ACA CAG ATG GGA CAG GAA GTG ATC TTG CGC TGT GTC CCC ATC TCT 191 Val Thr Gln Met Gly Gln Glu Val île Leu Arg Cys Val Pro Ile Ser  GTC ACA CAG ATG GGA CAG GAA GTG ATC TTG CGC TGT GTC CCC ATC TCT 191 Val Thr Gln Met Gly Gln Glu Val île Leu Arg Cys Val Pro Ile Ser
35 40 45  35 40 45
AAT CAC TTA TAC TTC TAT TGG TAC AGA CAA ATC TTG GGG CAG AAA GTC 239 Asn His Leu Tyr Phe Tyr Trp Tyr Arg Gln Ile Leu Gly Gln Lys Val  AAT CAC TTA TAC TTC TAT TGG TAC AGA CAA ATC TTG GGG CAG AAA GTC 239 Asn His Leu Tyr Phe Tyr Trp Tyr Arg Gln Ile Leu Gly Gln Lys Val
50 55 60  50 55 60
GAG TTT CTG GTT TCC TTT TAT AAT AAT GAA ATC TCA GAG AAG TCT GAA 287 Glu Phe Leu Val Ser Phe Tyr Asn Asn Glu Ile Ser Glu Lys Ser Glu  GAG TTT CTG GTT TCC TTT TAT AAT AAT GAA ATC TCA GAG AAG TCT GAA 287 Glu Phe Leu Val Ser Phe Tyr Asn Asn Glu Ile Ser Glu Lys Ser Glu
65 70 75  65 70 75
ATA TTC GAT GAT CAA TTC TCA GTT GAA AGG CCT GAT GGA TCA AAT TTC 335 Ile Phe Asp Asp Gln Phe Ser Val Glu Arg Pro Asp Gly Ser Asn Phe  ATA TTC GAT GAT CAA TTC TCA GTT GAA AGG CCT GAT GGA TCA AAT TTC 335 Ile Phe Asp Asp Gln Phe Ser Val Glu Arg Pro Asp Gly Ser Asn Phe
80 85 90  80 85 90
ACT CTG AAG ATC CGG TCC ACA AAG CTG GAG GAC TCA GCC ATG TAC TTC 383 Thr Leu Lys Ile Arg ser Thr Lys Leu Glu Asp Ser Ala Met Tyr Phe 95 100 105 110 ACT CTG AAG ATC CGG TCC ACA AAG CTG GAG GAC TCA GCC ATG TAC TTC 383 Thr Leu Lys Ile Arg ser Thr Lys Leu Glu Asp Ser Ala Met Tyr Phe 95 100 105 110
TGT GCC AGC AGT 395TGT GCC AGC AGT 395
Cys Ala Ser Ser V - INFORMATION POUR SEQ ID N° 4 Cys Ala Ser Ser V - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 4
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 329 paires de bases  LENGTH: 329 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
SEQUENCE CONSENSUS ORIGINE SEQUENCE CONSENSUS ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES NOM DE L'ADN : IGR b 04  CELL LINE: human T cells CHARACTERISTICS DNA NAME: IGR b 04
SEQUENCE V/3 w23  SEQUENCE V / 3 w23
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AGCTCCTCTG CCATGTC ATG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GCT TCA GTG 47 AGCTCCTCTG CCATGTC ATG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GCT TCA GTG 47
Met Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Ser Val Met Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Ser Val
1 5 101 5 10
GCT GCT GGA GTC ATC CAG TCC CCA AGA CAT CTG ATC AAA GAA AAG AGG 95 Ala Ala Gly Val Ile Gln Ser Pro Arg His Leu Ile Lys Glu Lys Arg GCT GCT GGA GTC ATC CAG TCC CCA AGA CAT CTG ATC AAA GAA AAG AGG 95 Ala Ala Gly Val Ile Gln Ser Pro Arg His Leu Ile Lys Glu Lys Arg
15 20 25  15 20 25
GAA ACA GCC ACT CTG AAA TGC TAT CCT ATC CCT AGA CAC GAC ACT GTC 143 Glu Thr Ala Thr Leu Lys Cys Tyr Pro Ile Pro Arg His Asp Thr Val  GAA ACA GCC ACT CTG AAA TGC TAT CCT ATC CCT AGA CAC GAC ACT GTC 143 Glu Thr Ala Thr Leu Lys Cys Tyr Pro Ile Pro Arg His Asp Thr Val
30 35 40 30 35 40
TAC TGG TAC CAG CAG GGT CCA GGT CAG GAC CCC CAG TTC CTC ATT TCG 191 Tyr Trp Tyr Gln Gln Gly Pro Gly Gln Asp Pro Gln Phe Leu Ilo Ser TAC TGG TAC CAG CAG GGT CCA GGT CAG GAC CCC CAG TTC CTC ATT TCG 191 Tyr Trp Tyr Gln Gln Gly Pro Gly Gln Asp Pro Gln Phe Leu Ilo Ser
45 50 05  45 50 05
TTT TAT GAA AAG ATG CAG AGC GAT AAA GGA AGC ATC CCT GAT CGA TTC 239 Phe Tyr Glu Lys Met Gln Ser Asp Lys Gly Ser Ile Pro Asp Arg Phe  TTT TAT GAA AAG ATG CAG AGC GAT AAA GGA AGC ATC CCT GAT CGA TTC 239 Phe Tyr Glu Lys Met Gln Ser Asp Lys Gly Ser Ile Pro Asp Arg Phe
60 65 70  60 65 70
TCA GCT CAA CAG TTC AGT GAC TAT CAT TCT GAA CTG AAC ATG AGC TCC 287 Ser Ala Gln Gln Phe Ser Asp Tyr His Ser Glu Leu Asn Met Ser Ser 75 80 85 90  TCA GCT CAA CAG TTC AGT GAC TAT CAT TCT GAA CTG AAC ATG AGC TCC 287 Ser Ala Gln Gln Phe Ser Asp Tyr His Ser Glu Leu Asn Met Ser Ser 75 80 85 90
TTG GAG CTG GGG GAC TCA GCC CTG TAC TTC TGT GCC AGC AGC 329 Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Ser Ser  TTG GAG CTG GGG GAC TCA GCC CTG TAC TTC TGT GCC AGC AGC 329 Leu Glu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Phe Cys Ala Ser Ser
95 100 VI - INFORMATION POUR SEQ ID N° 5 95,100 VI - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 5
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 366 paires de bases  LENGTH: 366 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 05 DNA NAME: IGR b 05
SEQUENCE Vβ W24  SEQUENCE Vβ W24
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
ATTCCTGTAT GGGGTGGTAT TCCTGCC ATG GGT CCT GGG CTT CTC CAC 48 ATTCCTGTAT GGGGTGGTAT TCCTGCC ATG GGT CCT GGG CTT CTC CAC 48
Met Gly Pro Gly Leu Leu His 1 S  Met Gly Pro Gly Leu Leu His 1 S
TGG ATG GCC CTT TGT CTC CTT GGA ACA GGT CAT GGG GAT GCC ATG GTC 96 TGG ATG GCC CTT TGT CTC CTT GGA ACA GGT CAT GGG GAT GCC ATG GTC 96
Trp Met Ala Leu, Cys Leu Leu Gly Thr Gly His Gly Asp Ala Met Val Trp Met Ala Leu, Cys Leu Leu Gly Thr Gly His Gly Asp Ala Met Val
10 15 20  10 15 20
ATC CAG AAC CCA AGA TAC CAG GTT ACC CAG TTT GGA AAG CCA GTG ACC 144 Ile Gln Asn Pro Arg Tyr Gln Val Thr Gln Phe Gly Lys Pro Val Thr  ATC CAG AAC CCA AGA TAC CAG GTT ACC CAG TTT GGA AAG CCA GTG ACC 144 Ile Gln Asn Pro Arg Tyr Gln Val Thr Gln Phe Gly Lys Pro Val Thr
25 30 35  25 30 35
CTG AGT TGT TCT CAG ACT TTG AAC CAT AAC GTC ATG TAC TGG TAC CAG 192 Leu Ser Cys Ser Gln Thr Leu Asn His Asn Val Met Tyr Trp Tyr Gln 40 45 50 55  CTG AGT TGT TCT CAG ACT TTG AAC CAT AAC GTC ATG TAC TGG TAC CAG 192 Leu Ser Cys Ser Gln Thr Leu Asn His Asn Val Met Tyr Trp Tyr Gln 40 45 50 55
CAG AAG TCA AGT CAG GCC CCA AAG CTG CTG TTC CAC TAC TAT GAC AAA 240 Gln Lys Ser Ser Gln Ala Pro Lys Leu Leu Phe His Tyr Tyr Asp Lys  CAG AAG TCA AGT CAG GCC CCA AAG CTG CTG TTC CAC TAC TAT GAC AAA 240 Gln Lys Ser Ser Gln Ala Pro Lys Leu Leu Phe His Tyr Tyr Asp Lys
60 65 70  60 65 70
GAT TTT AAC AAT GAA GCA GAC ACC CCT GAT AAC TTC CAA TCC AGG AGG 288 Asp Phe Asn Asn Glu Ala Asp Thr Pro Asp Asn Phe Gln Ser Arg Arg  GAT TTT AAC AAT GAA GCA GAC ACC CCT GAT AAC TTC CAA TCC AGG AGG 288 Asp Phe Asn Asn Glu Ala Asp Thr Pro Asp Asn Phe Gln Ser Arg Arg
75 80 85  75 80 85
CCG AAC ACT TCT TTC TGC TTT CTT GAC ATC CGC TCA CCA GGC CTG GGG 336 CCG AAC ACT TCT TTC TGC TTT CTT GAC ATC CGC TCA CCA GGC CTG GGG 336
Pro Asn Thr Ser Phe cys Phe Leu Asp Ha Arg Ser Pro Gly Lau Gly Pro Asn Thr Ser Phe cys Phe Leu Asp Ha Arg Ser Pro Gly Lau Gly
90 95 100  90 95 100
GAC GCA GCC ATG TAC CTG TGT GCC ACC AGC 366 GAC GCA GCC ATG TAC CTG TGT GCC ACC AGC 366
Asp Ala Ala Met Tyr Leu Cys Ala Thr Ser Asp Ala Ala Met Tyr Leu Cys Ala Thr Ser
105 HO VII - INFORMATION POUR SEQ ID N' 6 105 HO VII - INFORMATION FOR SEQ ID N '6
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 238 paires de bases  LENGTH: 238 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L 'ADN : IGR b 06 DNA NAME: IGR b 06
SEQUENCE V/3 5  SEQUENCE V / 3 5
A GGA CAG CAA GCG ACT CTG AGA TGC TCT CCT ATC TCT GGG CAC ACC 46A GGA CAG CAA GCG ACT CTG AGA TGC TCT CCT ATC TCT GGG CAC ACC 46
Gly Gln Gln Ala Thr Leu Arg Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr 1 5 10 15Gly Gln Gln Ala Thr Leu Arg Cys Ser Pro Ile Ser Gly His Thr 1 5 10 15
AGT GTG TAC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CTG GGC CTC CAG CTC CTC 94AGT GTG TAC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CTG GGC CTC CAG CTC CTC 94
Ser Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Leu Gly Leu Gln Leu Leu Ser Val Tyr Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Leu Gly Leu Gln Leu Leu
20 25 30  20 25 30
CTT TGG TAT GAC GAG GGT GAA GAG AGA AAC AGA CGA AAC TTC CCT CCT 142 Leu Trp Tyr Aso Glu Gly Glu Glu Arg Asn Arg Gly Asn Phe Pro Pro  CTT TGG TAT GAC GAG GGT GAA GAG AGA AAC AGA CGA AAC TTC CCT CCT 142 Leu Trp Tyr Aso Glu Gly Glu Glu Arg Asn Arg Gly Asn Phe Pro Pro
35 40 45 AGA TTT TCA GGT CGC CAG TTC CCT AAT TAT AGC TCT CAG CTG AAT GTG 190 Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val  35 40 45 AGA TTT TCA GGT CGC CAG TTC CCT AAT TAT AGC TCT CAG CTG AAT GTG 190 Arg Phe Ser Gly Arg Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val
50 55 60  50 55 60
AAC GCC TTG GAG CTG GAG GAC TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 238 Asn Ala Leu Glu Leu Glu Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser  AAC GCC TTG GAG CTG GAG GAC TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 238 Asn Ala Leu Glu Leu Glu Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
65 65 70 65 65 70
VIII - INFORMATION POUR SEQ ID N° 7 VIII - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 7
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 192 paires de bases  LENGTH: 192 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L'ADN : IGR b 07 DNA NAME: IGR b 07
SEQUENCE Vβ 5  SEQUENCE Vβ 5
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
ACT GTG TCC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC 48ACT GTG TCC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC 48
Thr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe IleThr Val Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile
1 5 10 15 1 5 10 15
TTT CAG TAT TAT AGG GAG GAA GAG AAT GGC AGA GGA AAC TCC CCT CCT 96 TTT CAG TAT TAT AGG GAG GAA GAG AAT GGC AGA GGA AAC TCC CCT CCT 96
Phe Gln Tyr Tyr Arg Glu Glu Glu Asn Gly Arg Gly Asn Ser Pro Pro Phe Gln Tyr Tyr Arg Glu Glu Glu Asn Gly Arg Gly Asn Ser Pro Pro
20 25 30 20 25 30
AGA TTC TCA GGT CTC CAG TTC CCT AAT TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG 144 Arg Phe Ser Gly Lou Gln Phe Pro Asn Tyr Sor ser Glu Lou Asπ Val AGA TTC TCA GGT CTC CAG TTC CCT AAT TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG 144 Arg Phe Ser Gly Lou Gln Phe Pro Asn Tyr Sor ser Glu Lou Asπ Val
35 40 45  35 40 45
AAC GCC TTG GAG CTG GAC GAC TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 192 Asn Ala Leu Glu Leu Asp Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser  AAC GCC TTG GAG CTG GAC GAC TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 192 Asn Ala Leu Glu Leu Asp Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
50 55 60 50 55 60
IX - INFORMATION POUR SEQ ID Nº 8 IX - INFORMATION FOR SEQ ID Nº 8
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 371 paires de bases  LENGTH: 371 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L'ADN : IGR b 08 DNA NAME: IGR b 08
SEQUENCE Vβ 5  SEQUENCE Vβ 5
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
GAACTCACTG GGTTCTTCCC CACGAGUACC AACCCCTGAA TCAGCTGCAC 50 GAACTCACTG GGTTCTTCCC CACGAGUACC AACCCCTGAA TCAGCTGCAC 50
TGCTGCCTGC CCCACTGTGC C ATG GGC CCT GGG CTC CTC TGC TGG 95 TGCTGCCTGC CCCACTGTGC C ATG GGC CCT GGG CTC CTC TGC TGG 95
Met Gly Pro Gly Leu Leu Cys Trp 1 5  Met Gly Pro Gly Leu Leu Cys Trp 1 5
GTG CTG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GGC CCA GTG GAC GCT GGA GTC ACC 143 Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Pro Val Asp Ala Gly Val Thr  GTG CTG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GGC CCA GTG GAC GCT GGA GTC ACC 143 Val Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Pro Val Asp Ala Gly Val Thr
10 15 20  10 15 20
CAA AGT CCC ACA CAC CTG ATC AAA ACG AGA GGA CAG CAA GTG ACT CTG 191 Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu 25 30 35 40 CAA AGT CCC ACA CAC CTG ATC AAA ACG AGA GGA CAG CAA GTG ACT CTG 191 Gln Ser Pro Thr His Leu Ile Lys Thr Arg Gly Gln Gln Val Thr Leu 25 30 35 40
AGA TGC TCT CCT ATC TCT GAG CAC AAG AGT GTG TCC TGG TAC CAA CAG 239 Arg Cys Ser Prc Ile Ser Glu His Lys Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln AGA TGC TCT CCT ATC TCT GAG CAC AAG AGT GTG TCC TGG TAC CAA CAG 239 Arg Cys Ser Prc Ile Ser Glu His Lys Ser Val Ser Trp Tyr Gln Gln
45 50 55  45 50 55
GTC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC TTT CAG TAT TAT GAG AAA GAA 287 Val Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe Gln Tyr Tyr Glu Lys Glu  GTC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC TTT CAG TAT TAT GAG AAA GAA 287 Val Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe Gln Tyr Tyr Glu Lys Glu
60 65 70  60 65 70
GAG AGA GGA AGA GGA AAC TTC CCT GAT CGA TTC TCA GCT CGC CAG TTC 335 Glu Arg Gly Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg Phe Ser Ala Arg Gln Phe  GAG AGA GGA AGA GGA AAC TTC CCT GAT CGA TTC TCA GCT CGC CAG TTC 335 Glu Arg Gly Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg Phe Ser Ala Arg Gln Phe
75 80 85  75 80 85
CCT AAC TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG AAC GCC TTG TTG CTG GGG GAC 383 Pro Asn Tyr Ser Sur Glu Leu Asn Val Asn Ala Leu Leu Leu Gly Asp  CCT AAC TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG AAC GCC TTG TTG CTG GGG GAC 383 Pro Asn Tyr Ser Sur Glu Leu Asn Val Asn Ala Leu Leu Leu Gly Asp
90 95 100  90 95 100
TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 410 TCG GCC CTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 410
Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
105 110 X - INFORMATION POUR SEQ ID Nº 9 105 110 X - INFORMATION FOR SEQ ID Nº 9
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 380 paires de bases  LENGTH: 380 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L'ADN : IGR b 09 DNA NAME: IGR b 09
SEQUENCE Vβ 5  SEQUENCE Vβ 5
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AAGCCCTGAA TCAGATGCAG TGCTTCCTGTC CCTCTGTGCC ATG GGC 47 AAGCCCTGAA TCAGATGCAG TGCTTCCTGTC CCTCTGTGCC ATG GGC 47
Met Gly Met gly
1 1
CCC GGG CTC CTC TGC TGG GCA CTG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GGC TTA 95 Pro Gly Leu Leu Cys Trp Ala Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Leu  CCC GGG CTC CTC TGC TGG GCA CTG CTT TGT CTC CTG GGA GCA GGC TTA 95 Pro Gly Leu Leu Cys Trp Ala Leu Leu Cys Leu Leu Gly Ala Gly Leu
5 10 15 5 10 15
GTG GAC GCT GCA CTC ACC CAA AGT CCC ACA CAC CTG ATC AAA ACG AGA 143 Val Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Lou Ile Lys Thr Arg GTG GAC GCT GCA CTC ACC CAA AGT CCC ACA CAC CTG ATC AAA ACG AGA 143 Val Asp Ala Gly Val Thr Gln Ser Pro Thr His Lou Ile Lys Thr Arg
20 25 30  20 25 30
GGA CAG CAA GTG ACT CTG AGA TGC TCT CCT AAG TCT GGG CAT GAC ACT 191 Gly Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His Asp Thr  GGA CAG CAA GTG ACT CTG AGA TGC TCT CCT AAG TCT GGG CAT GAC ACT 191 Gly Gln Gln Val Thr Leu Arg Cys Ser Pro Lys Ser Gly His Asp Thr
35 40 45  35 40 45
GTG TCC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC TTT 239 Val Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe 50 55 60 65  GTG TCC TGG TAC CAA CAG GCC CTG GGT CAG GGG CCC CAG TTT ATC TTT 239 Val Ser Trp Tyr Gln Gln Ala Leu Gly Gln Gly Pro Gln Phe Ile Phe 50 55 60 65
CAG TAT TAT GAG GAG GAA GAG AGA CAG AGA GGC AAC TTC CCT GAT CGA 287 Gln Tyr Tyr G1M Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg  CAG TAT TAT GAG GAG GAA GAG AGA CAG AGA GGC AAC TTC CCT GAT CGA 287 Gln Tyr Tyr G1M Glu Glu Glu Arg Gln Arg Gly Asn Phe Pro Asp Arg
70 75 80  70 75 80
TTC TCA GGT CAC CAG TTC CCT AAC TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG AAC 335 Phe Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val Asn  TTC TCA GGT CAC CAG TTC CCT AAC TAT AGC TCT GAG CTG AAT GTG AAC 335 Phe Ser Gly His Gln Phe Pro Asn Tyr Ser Ser Glu Leu Asn Val Asn
85 90 95  85 90 95
GCC TTG TTG CTG GGG GAC TCG GCC CTC TAT CTC TGT GCC AGC AGC 380 Ala Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser  GCC TTG TTG CTG GGG GAC TCG GCC CTC TAT CTC TGT GCC AGC AGC 380 Ala Leu Leu Leu Gly Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
100 105 110 I - INFORMATION POUR SEQ ID N° 10 100 105 110 I - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 10
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 351 paires de bases  LENGTH: 351 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 11 DNA NAME: IGR b 11
SEQUENCE Vβ 6  SEQUENCE Vβ 6
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
GACCCTGCC ATG GGC ACC AGT CTC CTA TGC TGG GTG GTC CTG GGT TTC 48 GACCCTGCC ATG GGC ACC AGT CTC CTA TGC TGG GTG GTC CTG GGT TTC 48
Met Gly Thr Ser Leu Leu Cys Trp Val Val Leu Gly Phe Met Gly Thr Ser Leu Leu Cys Trp Val Val Leu Gly Phe
1 5 10 1 5 10
CTA GGG ACA GAT CAC ACA GGT GCT GGA GTC TCC CAG TCT CCC AGG TAC 96 Leu Gly Thr Asp His Thr Gly Ala Gly Val Ser Gln Ser Pro Arg Tyr  CTA GGG ACA GAT CAC ACA GGT GCT GGA GTC TCC CAG TCT CCC AGG TAC 96 Leu Gly Thr Asp His Thr Gly Ala Gly Val Ser Gln Ser Pro Arg Tyr
15 20 25  15 20 25
AAA GTC ACA AAG AGG GGA CAG GAT GTA GCT CTC AGG TGT GAT CCA ATC 144 Gln Val Thr Lys Arg Gly Gln Asp Val Ala Leu Arg Cys Asp Pro Ile  AAA GTC ACA AAG AGG GGA CAG GAT GTA GCT CTC AGG TGT GAT CCA ATC 144 Gln Val Thr Lys Arg Gly Gln Asp Val Ala Leu Arg Cys Asp Pro Ile
30 35 40 45 30 35 40 45
TCG GGT CAT GTA TCC CTT TAT TGG TAC CGA CAG GCC CTG GGG CAG GGC 192 Ser Gly His Val Ser Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Ala Leu Gly Gln Gly  TCG GGT CAT GTA TCC CTT TAT TGG TAC CGA CAG GCC CTG GGG CAG GGC 192 Ser Gly His Val Ser Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Ala Leu Gly Gln Gly
50 55 60  50 55 60
CCA GAG TTT CTG ACT TAC TTC AAT TAT GAA GCC CAA CAA GAC AAA TCA 240 Pro Glu Phe Leu Thr Tyr Phe Asn Tyr Glu Ala Gln Gln Asp Lys Ser  CCA GAG TTT CTG ACT TAC TTC AAT TAT GAA GCC CAA CAA GAC AAA TCA 240 Pro Glu Phe Leu Thr Tyr Phe Asn Tyr Glu Ala Gln Gln Asp Lys Ser
65 70 75  65 70 75
GGG CTG CCC AAT GAT CGG TTC TCT GCA GAG AGG CCT GAG GGA TCC ATC 288 Gly Leu Pro Asn Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Pro Glu Gly Ser Ile  GGG CTG CCC AAT GAT CGG TTC TCT GCA GAG AGG CCT GAG GGA TCC ATC 288 Gly Leu Pro Asn Asp Arg Phe Ser Ala Glu Arg Pro Glu Gly Ser Ile
80 85 90  80 85 90
TCC ACT CTG ACG ATC CAG CGC ACA GAG CAG CGG GAC TCG GCC ATG TAT 336 Ser Thr Leu Thr Ile Gln Arg Thr Glu Gln Arg Asp Ser Ala Met Tyr  TCC ACT CTG ACG ATC CAG CGC ACA GAG CAG CGG GAC TCG GCC ATG TAT 336 Ser Thr Leu Thr Ile Gln Arg Thr Glu Gln Arg Asp Ser Ala Met Tyr
95 100 105  95 100 105
CGC TGT GCC AGC AGC 351 CGC TGT GCC AGC AGC 351
Arg Cys Ala Ser Ser Arg Cys Ala Ser Ser
110 II - INFORMATION POUR SEQ ID N' 11 110 II - INFORMATION FOR SEQ ID N '11
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 238 paires de bases  LENGTH: 238 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L 'ADN : IGR b 12 DNA NAME: IGR b 12
SEQUENCE Vβ 6  SEQUENCE Vβ 6
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
A AAG GAT GTA GAG CTC AGG TGT GAT CCA ATT TCA GGT CAT ACT GCC 46 Lys Asp Val Glu Leu Arg Cys Asp Pro Ile Ser Gly His Thr Ala 1 5 10 15A AAG GAT GTA GAG CTC AGG TGT GAT CCA ATT TCA GGT CAT ACT GCC 46 Lys Asp Val Glu Leu Arg Cys Asp Pro Ile Ser Gly His Thr Ala 1 5 10 15
CTT TAC TGG TAC CGA CAG AGC CTG GGG CAG GGC CTG GAG TTT TTA ATT 94 Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Ser Leu Gly Gln Gly Leu Glu Phe Leu Ila CTT TAC TGG TAC CGA CAG AGC CTG GGG CAG GGC CTG GAG TTT TTA ATT 94 Leu Tyr Trp Tyr Arg Gln Ser Leu Gly Gln Gly Leu Glu Phe Leu Ila
20 25 30  20 25 30
TAC TTC CAA GGC AAC AGT GCA CCA GAC AAA TCA GGG CTG CCC AAC GAT 142 Tyr Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro Asp Lys Ser Gly Leu Pro Asn Asp  TAC TTC CAA GGC AAC AGT GCA CCA GAC AAA TCA GGG CTG CCC AAC GAT 142 Tyr Phe Gln Gly Asn Ser Ala Pro Asp Lys Ser Gly Leu Pro Asn Asp
35 40 45  35 40 45
CGG TTC TTT GCA GTC AGG CCT GAG GGA TCC GTC TCT ACT CTG AGG ATC 190 Arg Phe Phe Ala Val Arg Pro Glu Gly Ser Val Ser Thr Leu Arg Ile  CGG TTC TTT GCA GTC AGG CCT GAG GGA TCC GTC TCT ACT CTG AGG ATC 190 Arg Phe Phe Ala Val Arg Pro Glu Gly Ser Val Ser Thr Leu Arg Ile
50 55 60  50 55 60
CAG CGC ACA GAO CGG GGG GAC TCA GCC GTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 238 Gln Arg Thr Glu Arg Gly Asp Ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser Ser  CAG CGC ACA GAO CGG GGG GAC TCA GCC GTG TAT CTC TGT GCC AGC AGC 238 Gln Arg Thr Glu Arg Gly Asp Ser Ala Val Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
65 70 75 65 70 75
XIII - INFORMATION POUR SEQ ID N º 12 XIII - INFORMATION FOR SEQ ID N º 12
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 294 paires de bases  LENGTH: 294 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 13 DNA NAME: IGR b 13
SEQUENCE Vβ 12  SEQUENCE Vβ 12
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
TCA GGA CAC AGG GAT GCT GAA ATC ACC CAG AGC CCA AGA CAC AAG ATC 48TCA GGA CAC AGG GAT GCT GAA ATC ACC CAG AGC CCA AGA CAC AAG ATC 48
Ser Gly His Arg Asp Ala Glu Ile Thr Gln Ser Pro Arg His Lys Ile 1 5 10 15 Ser Gly His Arg Asp Ala Glu Ile Thr Gln Ser Pro Arg His Lys Ile 1 5 10 15
ACA GAG ACA GCA AGG CAG GTG ACC TTG GCG TGT CAC CAG ACT TGG AAC 96 ACA GAG ACA GCA AGG CAG GTG ACC TTG GCG TGT CAC CAG ACT TGG AAC 96
Thr Glu Thr Gl y Arg Gln Val Thr Leu Ala Cys His Gln Thr Trp Asn Thr Glu Thr Gl y Arg Gln Val Thr Leu Ala Cys His Gln Thr Trp Asn
20 25 30 20 25 30
CAC AAC AAT ATG TTC TGG TAT CGA CAA GAC CTG CCA CAT GGG CTG AGG 144 His Asn Asn Met Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Leu Gly His Gly Leu Arg . CAC AAC AAT ATG TTC TGG TAT CGA CAA GAC CTG CCA CAT GGG CTG AGG 144 His Asn Asn Met Phe Trp Tyr Arg Gln Asp Leu Gly His Gly Leu Arg.
35 40 45  35 40 45
CTG ATC CAT TAC TCA TAT GGT GTT CAA GAC ACT AAC AAA GGA GAA GTC 192 Leu Ile His Tyr Ser Tyr Gly Val Gln Asp Thr Asn Lys Gly Glu Val  CTG ATC CAT TAC TCA TAT GGT GTT CAA GAC ACT AAC AAA GGA GAA GTC 192 Leu Ile His Tyr Ser Tyr Gly Val Gln Asp Thr Asn Lys Gly Glu Val
50 55 60  50 55 60
TCA GAT GGC TAC AGT GTC TCT AGA TCA AAC ACA GAG GAC CTC CCC CTC 240 Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser Arg Ser Asn Thr Glu Asp Leu Pro Leu 65 70 75 80  TCA GAT GGC TAC AGT GTC TCT AGA TCA AAC ACA GAG GAC CTC CCC CTC 240 Ser Asp Gly Tyr Ser Val Ser Arg Ser Asn Thr Glu Asp Leu Pro Leu 65 70 75 80
ACT CTG GAG TCT GCT GCC TCC TCC CAG ACA TCT GTA TAT TTC TGC GCC 288 Thr Leu Glu Ser Ala Ala Ser Ser Gln Thr Ser Val Tyr Phe Cys Ala  ACT CTG GAG TCT GCT GCC TCC TCC CAG ACA TCT GTA TAT TTC TGC GCC 288 Thr Leu Glu Ser Ala Ala Ser Ser Gln Thr Ser Val Tyr Phe Cys Ala
85 90 95  85 90 95
AGC AGT 294 AGC AGT 294
Ser Ser XIV - INFORMATION POUR SEQ ID Nº 13 Ser Ser XIV - INFORMATION FOR SEQ ID Nº 13
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 369 paires de bases  LENGTH: 369 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L 'ADN : IGR b 14 DNA NAME: IGR b 14
SEQUENCE V/3 13  SEQUENCE V / 3 13
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AGAAGACCCC TCCATCCTGT AGCACCTGCC ATG AGC ATC GGG CTC CTG 48 AGAAGACCCC TCCATCCTGT AGCACCTGCC ATG AGC ATC GGG CTC CTG 48
Met Ser Ile Gly Leu Leu 1 5  Met Ser Ile Gly Leu Leu 1 5
TGC TGT GTG GCC TTT TCT CTC CTG TGG GCA AGT CCA GTG AAT GCT GGT 96 Cys Cys Val Ala Phe Sor LoU Lou Trp Ala Sor Pro VaL Ann Aln Gly  TGC TGT GTG GCC TTT TCT CTC CTG TGG GCA AGT CCA GTG AAT GCT GGT 96 Cys Cys Val Ala Phe Sor LoU Lou Trp Ala Sor Pro VaL Ann Aln Gly
10 15 20  10 15 20
GTC ACT CAG ACC CCA AAA TTC CAG GTC CTG AAG ACA GGA CAG AGC ATG 144 GTC ACT CAG ACC CCA AAA TTC CAG GTC CTG AAG ACA GGA CAG AGC ATG 144
Val Thr Gln Thr Pro Lys Phe Gln Val Leu Lys Thr Gly Gln Ser Met Val Thr Gln Thr Pro Lys Phe Gln Val Leu Lys Thr Gly Gln Ser Met
25 30 35  25 30 35
ACA CTG CAG TGT GCC CAG GAT ATG AAC CAT AAC TCC ATG TAC TGG TAT 192 Thr Leu Gln Cys Ala Gln Asp Met Asn His Asn Sor Met Tyr Trp Tyr  ACA CTG CAG TGT GCC CAG GAT ATG AAC CAT AAC TCC ATG TAC TGG TAT 192 Thr Leu Gln Cys Ala Gln Asp Met Asn His Asn Sor Met Tyr Trp Tyr
40 45 50  40 45 50
CGA CAA GAC CCA GGC ATG GGA CTG AGG CTG ATT TAT TAC TCA GCT TCT 240 Arg Gln Aep Pro Gly Met Gly I_su Arg Lou Ile Tyr Tyr Ser Ala Sor 55 60 ûϋ 70  CGA CAA GAC CCA GGC ATG GGA CTG AGG CTG ATT TAT TAC TCA GCT TCT 240 Arg Gln Aep Pro Gly Met Gly I_su Arg Lou Ile Tyr Tyr Ser Ala Sor 55 60 ûϋ 70
GAG GGT ACC ACT GAC AAA GGA GAA GTC CCC AAT GGC TAC AAT GTC TCC 288 Glu Gly Thr Thr Asp Lys Gly Glu Val Pro Asn Gly Tyr Asn Val Ser  GAG GGT ACC ACT GAC AAA GGA GAA GTC CCC AAT GGC TAC AAT GTC TCC 288 Glu Gly Thr Thr Asp Lys Gly Glu Val Pro Asn Gly Tyr Asn Val Ser
75 80 85  75 80 85
AGA TTA AAC AAA CGG GAG TTC TCG CTC AGG CTG GAG TCG GCT GCT CCC 336 Arg Leu Asn Lys Arg Glu Phe Ser Leu Arg Leu Glu Ser Ala Ala Pro  AGA TTA AAC AAA CGG GAG TTC TCG CTC AGG CTG GAG TCG GCT GCT CCC 336 Arg Leu Asn Lys Arg Glu Phe Ser Leu Arg Leu Glu Ser Ala Ala Pro
90 95 100  90 95 100
TCC CAG ACA Td GTG TAC TTC TGT GCC AGC ACC 369 TCC CAG ACA Td GTG TAC TTC TGT GCC AGC ACC 369
Ser Gln Thr Ser Val Tyr Phe Cys Ala Ser Thr Ser Gln Thr Ser Val Tyr Phe Cys Ala Ser Thr
105 HO XV - INFORMATION POUR SEQ ID N º 14 105 HO XV - INFORMATION FOR SEQ ID N º 14
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 356 paires de bases  LENGTH: 356 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 15 DNA NAME: IGR b 15
SEQUENCE Vβ 13  SEQUENCE Vβ 13
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
TGCTTGTAGC ATCTGCC ATG AGA ATC AGG CTC CTG TGC TGT GTG GCC 47 TGCTTGTAGC ATCTGCC ATG AGA ATC AGG CTC CTG TGC TGT GTG GCC 47
Met Arg Ile Arg Leu lou Cys Cys Val Ala 1 5 10  Met Arg Ile Arg Leu lou Cys Cys Val Ala 1 5 10
TTT TCT CTC CTG TGG GCA GGT CCA GTG ATT GCT GGG ATC ACC CAG GCA 95 TTT TCT CTC CTG TGG GCA GGT CCA GTG ATT GCT GGG ATC ACC CAG GCA 95
Phe Ser Leu Leu Trp Ala Gly Pro Val Ile Ala Gly Ile Thr Gln Ala Phe Ser Leu Leu Trp Ala Gly Pro Val Ile Ala Gly Ile Thr Gln Ala
15 20 25  15 20 25
CCA ACA TCT CAG ATC CTG GCA GCA GGA CGG CGC ATG ACA CTG AGA TGT 143 Pro Thr Ser Gln Ile Leu Ala Ala Gly Arg Arg Met Thr Leu Arg Cys  CCA ACA TCT CAG ATC CTG GCA GCA GGA CGG CGC ATG ACA CTG AGA TGT 143 Pro Thr Ser Gln Ile Leu Ala Ala Gly Arg Arg Met Thr Leu Arg Cys
30 35 40  30 35 40
ACC CAG GAT ATG AGA CAT AAT GCC ATG TAC TGG TAT AGA CAA GAT CTA 191 Thr Gln Asp Met Arg His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Leu  ACC CAG GAT ATG AGA CAT AAT GCC ATG TAC TGG TAT AGA CAA GAT CTA 191 Thr Gln Asp Met Arg His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Leu
45 50 55  45 50 55
GGA CTG GGG CTA AGG CTC ATC CAT TAT TCA AAT ACT GCA GGT ACC ACT 239 Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile His Tyr Ser Asn Thr Ala Gly Thr Thr  GGA CTG GGG CTA AGG CTC ATC CAT TAT TCA AAT ACT GCA GGT ACC ACT 239 Gly Leu Gly Leu Arg Leu Ile His Tyr Ser Asn Thr Ala Gly Thr Thr
60 65 70  60 65 70
GGC AAA GGA GAA GTC CCT GAT GGT TAT AGT GTC TCC AGA GCA AAC ACA 287 Gly Lys Gly Glu Val Pro Asp Gly Tyr Ser Va l Sor Arg Ala Asn Thr 75 80 85 90  GGC AAA GGA GAA GTC CCT GAT GGT TAT AGT GTC TCC AGA GCA AAC ACA 287 Gly Lys Gly Glu Val Pro Asp Gly Tyr Ser Va l Sor Arg Ala Asn Thr 75 80 85 90
GAT GAT TTC CCC CTC ACG TTG GCG TCT GCT GTA CCC TCT CAG ACA TCT 335 GAT GAT TTC CCC CTC ACG TTG GCG TCT GCT GTA CCC TCT CAG ACA TCT 335
Asp Asp Phe Pro Leu Thr Leu Ala Ser Ala Val Pro Ser Gln Thr Ser Asp Asp Phe Pro Leu Thr Leu Ala Ser Ala Val Pro Ser Gln Thr Ser
95 100 105  95 100 105
GTG TAC TTC TGT GCC AGC AGT 356 GTG TAC TTC TGT GCC AGC AGT 356
Val Tyr Phe Cys Ala Ser Ser Val Tyr Phe Cys Ala Ser Ser
110 XVI - INFORMATION POUR SEQ ID N° 15 110 XVI - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 15
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 345 paires de bases  LENGTH: 345 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
SEQUENCE CONSENSUS ORIGINE SEQUENCE CONSENSUS ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES NOM DE L'ADN : IGR b 16  CHARACTERISTICS NAME OF DNA: IGR b 16
SEQUENCE Vβ  SEQUENCE Vβ
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AAGGCCCAGC CCCTTTCCAT TGGGGCTGCA GCATCAGCTG TTTCCTTCTC 50 AAGGCCCAGC CCCTTTCCAT TGGGGCTGCA GCATCAGCTG TTTCCTTCTC 50
TGCAGGT CCA GTG AAT GCT GGT GTC ACT CAG ACC CCA AAA TTC CGC 96 TGCAGGT CCA GTG AAT GCT GGT GTC ACT CAG ACC CCA AAA TTC CGC 96
Pro Val Asn Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Lys Phe Arg 1 5 10  Pro Val Asn Ala Gly Val Thr Gln Thr Pro Lys Phe Arg 1 5 10
ATC CTG AAG ATA GGA CAG AGC ATG ACA CTG CAG TGT GCC CAG GAT ATG 144 Ile Leu Lys Ile Gly Gln Ser Met Thr Leu Gln Cys Ala Gln Asp Met  ATC CTG AAG ATA GGA CAG AGC ATG ACA CTG CAG TGT GCC CAG GAT ATG 144 Ile Leu Lys Ile Gly Gln Ser Met Thr Leu Gln Cys Ala Gln Asp Met
15 20 25  15 20 25
AAC CAT AAC TAC ATG TAC TGG TAT CGA CAA GAC CCA CGC ATC CCC CTG 192AA C CAT AAC TAC ATG TAC TGG TAT CGA CAA GAC CCA CGC ATC CCC CTG 192
Asn His Asn Tyr Met Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Met Gly Leu 30 35 40 45 Asn His Asn Tyr Met Tyr Trp Tyr Arg Gln Asp Pro Gly Met Gly Leu 30 35 40 45
AAG CTG ATT TAT TAT TCA GTT GGT GCT GGT ATC ACT GAT AAA GCA GAA 240 Lys Leu Ile Tyr Tyr Ser Val Gly Ala Gly Ile Thr Asp Lys Gly Glu  AAG CTG ATT TAT TAT TCA GTT GGT GCT GGT ATC ACT GAT AAA GCA GAA 240 Lys Leu Ile Tyr Tyr Ser Val Gly Ala Gly Ile Thr Asp Lys Gly Glu
50 55 60  50 55 60
GTC CCG AAT GGC TAC AAC GTC TCC AGA TCA ACC ACA GAG GAT TTC CCG 288 Val Pro Asn Gly Tyr Asn Val Ser Arg Ser Thr Thr Glu Asp Phe Pro GTC C CG AAT GGC TAC AAC GTC TCC AGA TCA ACC ACA GAG GAT TTC CCG 288 Val Pro Asn Gly Tyr Asn Val Ser Arg Ser Thr Thr Glu Asp Phe Pro
65 70 75  65 70 75
CTC AGG CTG GAG TTG GCT GCT CCC TCC CAG ACA TCT GTG TAC TTC TGT 336 Leu Arg Leu Glu Leu Ala Ala Pro Ser Gln Thr Ser val Tyr Phe cys C TC AGG CTG GAG TTG GCT GCT CCC TCC CAG ACA TCT GTG TAC TTC TGT 336 Leu Arg Leu Glu Leu Ala Ala Pro Ser Gln Thr Ser val Tyr Phe cys
80 85 90  80 85 90
GCC AGC AGT 345 GCC AGC AGT 345
Ala Ser Ser Ala Ser Ser
95 XVII - INFORMATION POUR SEQ ID N° 16 95 XVII - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 16
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 450 paires de bases  LENGTH: 450 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 17 DNA NAME: IGR b 17
SEQUENCE Vβ 7  SEQUENCE Vβ 7
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
TGGAGCAGTG ACATCACAGG AAAAACCACC AACCAAGGCC 40 TGGAGCAGTG ACATCACAGG AAAAACCACC AACCAAGGCC 40
AAGGAGACCA GAGCCCAGCA CCTCACCCAG AGGACCCCAG TCAGAGGCCC CATCTCAGAC 100 AAGGAGACCA GAGCCCAGCA CCTCACCCAG AGGACCCCAG TCAGAGGCCC CATCTCAGAC 100
CCGAGGC'AG C ATG GGC TGC AGG CTG CTC TGC TGT GCG GTT CTC 144 CCGAGGC'AG C ATG GGC TGC AGG CTG CTC TGC TGT GCG GTT CTC 144
Met Gly Cys Arg Leu Leu Cys Cys Ala Val Leu 1 5 10  Met Gly Cys Arg Leu Leu Cys Cys Ala Val Leu 1 5 10
TGT CTC CTG GGA GCG GTC CCC ATG GAA ACG GGA GTT ACG CAG ACA CCA 192 Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Met Glu Thr Gly Val Thr Gln Thr Pro  TGT CTC CTG GGA GCG GTC CCC ATG GAA ACG GGA GTT ACG CAG ACA CCA 192 Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Met Glu Thr Gly Val Thr Gln Thr Pro
15 20 25  15 20 25
AGA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG TCT TTG AAA TGT GAA 240 Arg His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys Ser Leu Lys Cys Glu  AGA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG TCT TTG AAA TGT GAA 240 Arg His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys Ser Leu Lys Cys Glu
30 35 40  30 35 40
CAA CAT CTG GGG CAT AAC GCT ATG TAT TGG TAC AAG CAA AGT GCT AAG 288 Gln His Leu Gly His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Ser Ala Lys  CAA CAT CTG GGG CAT AAC GCT ATG TAT TGG TAC AAG CAA AGT GCT AAG 288 Gln His Leu Gly His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Ser Ala Lys
45 50 55  45 50 55
AAG CCA CTG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AAC TTT AAA GAA CAG ACT GAA 336 Lys Pro Leu Glu Leu Met Phe Val Tyr Asn Phe Lys Glu Gln Thr Glu 60 65 70 75  AAG CCA CTG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AAC TTT AAA GAA CAG ACT GAA 336 Lys Pro Leu Glu Leu Met Phe Val Tyr Asn Phe Lys Glu Gln Thr Glu 60 65 70 75
AAC AAC AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA TGC CCC AAC AGC TCT 384 Asn Asn Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu Cys Pro Asn Ser Ser  AAC AAC AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA TGC CCC AAC AGC TCT 384 Asn Asn Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu Cys Pro Asn Ser Ser
80 85 90  80 85 90
CAC TTA TGC CTT CAC CTA CAC ACC CTG CAG CCA GAA GAC TCG GCC CTG 432 His Leu Cys Leu His Leu His Thr Leu Gln Pro Glu Asp Ser ^Ala Led  CAC TTA TGC CTT CAC CTA CAC ACC CTG CAG CCA GAA GAC TCG GCC CTG 432 His Leu Cys Leu His Leu His Thr Leu Gln Pro Glu Asp Ser ^ Ala Led
95 100 105 95 100 105
TAT CTC TGT GCC AGC ACC 450TAT CTC TGT GCC AGC ACC 450
Tyr Leu Cys Ala ser Thr Tyr Leu Cys Ala ser Thr
110 XVIII - INFORMATION POUR SEQ ID N° 17 110 XVIII - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 17
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 354 paires de bases  LENGTH: 354 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L ' ADN : IGR b 18 DNA NAME: IGR b 18
SEQUENCE Vβ 7  SEQUENCE Vβ 7
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AGACCCGAGG CTAGC ATG GGC TGC AGG CTG CTC TGC TCT GCG GTT CTC 48 AGACCCGAGG CTAGC ATG GGC TGC AGG CTG CTC TGC TCT GCG GTT CTC 48
Met Gly Cys Arg Leu Leu Cys Ser Ala Val Leu 1 5 10  Met Gly Cys Arg Leu Leu Cys Ser Ala Val Leu 1 5 10
TGT CTC CTG GGA GCG GTC CCC ATG GAA ACG GGA GTT ACG CAG ACA CCA 96 TGT CTC CTG GGA GCG GTC CCC ATG GAA ACG GGA GTT ACG CAG ACA CCA 96
Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Met Glu Thr Gly Val Thr Gln Thr Pro Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Met Glu Thr Gly Val Thr Gln Thr Pro
15 20 25 15 20 25
AGA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG TCT TTG AAA TGT GAA 144 Arg His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys Ser Leu Lys Cys Glu AGA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG TCT TTG AAA TGT GAA 144 Arg His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys Ser Leu Lys Cys Glu
30 35 40  30 35 40
CAA CAT CTG GGT CAT AAC GCT ATG TAT TGG TAC AAG CAA AGT GCT AAG 192 Gln His Leu Gly His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Ser Ala Lys  CAA CAT CTG GGT CAT AAC GCT ATG TAT TGG TAC AAG CAA AGT GCT AAG 192 Gln His Leu Gly His Asn Ala Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Ser Ala Lys
45 50 55  45 50 55
AAG CCA CTG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AGT CTT GAA GAA CGG GTT GAA 240 Lys Pro Leu Glu Leu Met Phe Val Tyr Ser Leu Glu Glu Arg Val Glu 60 65 70 75  AAG CCA CTG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AGT CTT GAA GAA CGG GTT GAA 240 Lys Pro Leu Glu Leu Met Phe Val Tyr Ser Leu Glu Glu Arg Val Glu 60 65 70 75
AAC AAC AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA TGC CCC AAC AGC TCT 288 Asn Asn Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu Cys Pro Asn Ser Ser  AAC AAC AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA TGC CCC AAC AGC TCT 288 Asn Asn Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu Cys Pro Asn Ser Ser
80 85 90  80 85 90
CAC TTA TCC CTT CAC CTA CAC ACC CTG CAG CCA GAA GAC TCG GCC CTG 336 His Leu Ser Leu His Leu His Thr Leu Gln Pro Glu Asp ser Ala Leu  CAC TTA TCC CTT CAC CTA CAC ACC CTG CAG CCA GAA GAC TCG GCC CTG 336 His Leu Ser Leu His Leu His Thr Leu Gln Pro Glu Asp ser Ala Leu
95 100 105 95 100 105
TAT CTC TGC GCC AGC AGC 354TAT CTC TGC GCC AGC AGC 354
Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
110 IX - INFORMATION POUR SEQ ID N° 18 110 IX - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 18
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 368 paires de bases  LENGTH: 368 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains CARACTERISTIQUES CELL LINE: Human T cells CHARACTERISTICS
NOM DE L'ADN : IGR b 19 DNA NAME: IGR b 19
SEQUENCE V/3 7  SEQUENCE V / 3 7
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
AGAGGCCCCA TCTCAGACCC GAGGCTAGC ATG GGC TGC AGG CTG CTC 47 AGAGGCCCCA TCTCAGACCC GAGGCTAGC ATG GGC TGC AGG CTG CTC 47
Met Gly Cys Arg Leu Leu 1 5  Met Gly Cys Arg Leu Leu 1 5
TGC TGT GCG GTT CTC TGT CTC CTG GGA GCA GTT CCC ATA GAC ACT GAA 95 Cys Cys Ala Val Leu Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Ile Asp Thr Glu  TGC TGT GCG GTT CTC TGT CTC CTG GGA GCA GTT CCC ATA GAC ACT GAA 95 Cys Cys Ala Val Leu Cys Leu Leu Gly Ala Val Pro Ile Asp Thr Glu
10 15 20  10 15 20
GTT ACC CAG ACA CCA AAA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG 143 Val Thr Gln Thr Pro Lys His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys  GTT ACC CAG ACA CCA AAA CAC CTG GTC ATG GGA ATG ACA AAT AAG AAG 143 Val Thr Gln Thr Pro Lys His Leu Val Met Gly Met Thr Asn Lys Lys
25 30 35  25 30 35
TCT TTG AAA TGT GAA CAA CAT ATG GGG CAC AGG GCT ATG TAT TGG TAC 191 Ser Leu Lys Cys Glu Gln His Met Gly His Arg Ala Met Tyr Trp Tyr  TCT TTG AAA TGT GAA CAA CAT ATG GGG CAC AGG GCT ATG TAT TGG TAC 191 Ser Leu Lys Cys Glu Gln His Met Gly His Arg Ala Met Tyr Trp Tyr
40 45 50  40 45 50
AAG CAG AAA GCT AAG AAG CCA CCG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AGC TAT 239 Lys Gln Lys Ala Lys Lys Pro Pro Glu Leu Met Phe Val Tyr Ser Tyr 55 60 65 70  AAG CAG AAA GCT AAG AAG CCA CCG GAG CTC ATG TTT GTC TAC AGC TAT 239 Lys Gln Lys Ala Lys Lys Pro Pro Glu Leu Met Phe Val Tyr Ser Tyr 55 60 65 70
GAG AAA CTC TCT ATA AAT GAA AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA 287 Glu Lys Leu Ser Ile Asn Glu Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu  GAG AAA CTC TCT ATA AAT GAA AGT GTG CCA AGT CGC TTC TCA CCT GAA 287 Glu Lys Leu Ser Ile Asn Glu Ser Val Pro Ser Arg Phe Ser Pro Glu
75 80 85"  75 80 85 "
TGC CCC AAC AGC TCT CTC TTA AAC CTT CAC CTA CAC GCC CTG CAG CCA 335 Cys Pro Asn Ser Ser Leu Leu Asn Leu His Leu His Ala Leu Gln Pro  TGC CCC AAC AGC TCT CTC TTA AAC CTT CAC CTA CAC GCC CTG CAG CCA 335 Cys Pro Asn Ser Ser Leu Leu Asn Leu His His His Ala Leu Gln Pro
90 95 100  90 95 100
GAA GAC TCA GCC CTG TAT CTC TGC GCC AGC AGC 368 GAA GAC TCA GCC CTG TAT CTC TGC GCC AGC AGC 368
Glu Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser Glu Asp Ser Ala Leu Tyr Leu Cys Ala Ser Ser
105 110 XX - INFORMATION POUR SEQ ID N° 19 105 110 XX - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 19
CARACTERISTIQUES DES SEQUENCES CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCES
TYPE : nucléotide et sa protéine corres- pondante TYPE: nucleotide and its corresponding protein
LONGUEUR : 432 paires de bases  LENGTH: 432 base pairs
NOMBRE DE BRINS : simple  NUMBER OF STRANDS: simple
CONFIGURATION : linéaire  CONFIGURATION: linear
TYPE DE MOLECULE : ADNc pour ARNm  TYPE OF MOLECULE: cDNA for mRNA
ORIGINE ORIGIN
ORGANISME : humain ORGANISM: human
LIGNEE CELLULAIRE : lymphocytes T humains  CELL LINE: human T cells
CARACTERISTIQUES CHARACTERISTICS
NOM DE L 'ADN : IGR b 20 DNA NAME: IGR b 20
SEQUENCE Vβ 9  SEQUENCE Vβ 9
DESCRIPTION DE LA SEQUENCE  DESCRIPTION OF THE SEQUENCE
ACCTCTCAAC GGCAGTGAAA CCACAGCCTA GTCCTCTCAC 40ACCTCTCAAC GGCAGTGAAA CCACAGCCTA GTCCTCTCAC 40
CACTGCAGAC CAGAATCCTG CCCTGGGCCT TGCCTCGTCT CCCTCACTCT GCC ATG 96 CACTGCAGAC CAGAATCCTG CCCTGGGCCT TGCCTCGTCT CCCTCACTCT GCC ATG 96
MET  MET
1  1
GGC TGC AGG CTC CTC TGC TGT GTG GTC TTC TGC CTC CTC CAA GCA GGT 144 Gly Cys Arg Leu Leu Cys Cys Val Val Phe Cys Lou Lou Gln Ala Gly  GGC TGC AGG CTC CTC TGC TGT GTG GTC TTC TGC CTC CTC CAA GCA GGT 144 Gly Cys Arg Leu Leu Cys Cys Val Val Phe Cys Lou Lou Gln Ala Gly
5 10 15  5 10 15
CCC TTG GAC ACA GCT GTT TCC CAG ACT CCA AAA TAC CTG GTC ACA CAG 192 Pro Leu Asp Thr Ala Val Ser Gln Thr Pro Lyn Tyr Lou Val Thr Gln  CCC TTG GAC ACA GCT GTT TCC CAG ACT CCA AAA TAC CTG GTC ACA CAG 192 Pro Leu Asp Thr Ala Val Ser Gln Thr Pro Lyn Tyr Lou Val Thr Gln
20 25 30  20 25 30
ATG GGA AAC GAC AAG TCC ATT AAA TGT GAA CAA AAT CTG GGC CAT GAT 240 Met Gly Asn Asp Lys Ser Ile Lys Cys Glu Gln Asn Leu Gly His Asp  ATG GGA AAC GAC AAG TCC ATT AAA TGT GAA CAA AAT CTG GGC CAT GAT 240 Met Gly Asn Asp Lys Ser Ile Lys Cys Glu Gln Asn Leu Gly His Asp
35 40 45  35 40 45
ACT ATG TAT TGG TAT AAA CAG GAC TCT AAG AAA TTT CTG AAG ATA ATG 288 Thr Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Asp Ser Lys Lys Phe Leu Lys Ile Met 50 55 60 65  ACT ATG TAT TGG TAT AAA CAG GAC TCT AAG AAA TTT CTG AAG ATA ATG 288 Thr Met Tyr Trp Tyr Lys Gln Asp Ser Lys Lys Phe Leu Lys Ile Met 50 55 60 65
TTT AGC TAC AAT AAT AAG GAG CTC ATT ATA AAT GAA ACA GTT CCA AAT 336 Phe Ser Tyr Asn Asn Lys Glu Leu Ile Ile Asn Glu Thr Val Pro Asn  TTT AGC TAC AAT AAT AAG GAG CTC ATT ATA AAT GAA ACA GTT CCA AAT 336 Phe Ser Tyr Asn Asn Lys Glu Leu Ile Asn Glu Thr Val Pro Asn
70 75 80  70 75 80
CGC TTC TCA CCT AAA TCT CCA GAC AAA GCT CAC TTA AAT CTT CAC ATC 384 Arg Phe Ser Pro Lys Ser Pro Asp Lys Ala His Leu Asn Leu His Ile  CGC TTC TCA CCT AAA TCT CCA GAC AAA GCT CAC TTA AAT CTT CAC ATC 384 Arg Phe Ser Pro Lys Ser Pro Asp Lys Ala His Leu Asn Leu His Ile
85 90 95  85 90 95
AAT TCC CTG GAG CTT GGT GAC TCT GCT GTG TAT TTC TGT GCC AGC AGC 432 Asn Ser Leu Glu Leu Gly Asp ser Ala Val Tyr Phe cys Ala Ser Ser  AAT TCC CTG GAG CTT GGT GAC TCT GCT GTG TAT TTC TGT GCC AGC AGC 432 Asn Ser Leu Glu Leu Gly Asp ser Ala Val Tyr Phe cys Ala Ser Ser
100 105 110 XXI - INFORMATION POUR SEQ ID N° 20 à 24 OLIGONUCLEOTIDES 100 105 110 XXI - INFORMATION FOR SEQ ID N ° 20 to 24 OLIGONUCLEOTIDES
SEQ ID N° 20 5'-TATCTGGAGTCATTGAGGGCGGGC SEQ ID N° 21 5'-GCATGCGCGCGGCCGCGGAGG-14CSEQ ID N ° 20 5'-TATCTGGAGTCATTGAGGGCGGGC SEQ ID N ° 21 5'-GCATGCGCGCGGCCGCGGAGG-14C
SEQ ID N° 22 5'-TGTGGCCAGGCATGCCAGTGTGGCCSEQ ID N ° 22 5'-TGTGGCCAGGCATGCCAGTGTGGCC
SEQ ID N° 23 5'-GGTGTGGGAGAATTCTGCTTCTGASEQ ID N ° 23 5'-GGTGTGGGAGAATTCTGCTTCTGA
SEQ ID N° 24 5'-TCTGCTTCTGATGGCTCAA. SEQ ID N ° 24 5'-TCTGCTTCTGATGGCTCAA.

Claims

REVENDICATIONS
1. Séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains, correspondant à des ADNc comprenant des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 2 à 19,  1. Nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding to cDNAs comprising nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID No 2 to 19,
et les séquences qui en diffèrent par un ou plusieurs nucléotides.  and the sequences which differ from it by one or more nucleotides.
2. Séquences selon la revendication 1 codant pour des régions variables des chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains, correspondant à des ADNc comprenant des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 2 à 5,  2. Sequences according to claim 1 coding for variable regions of the β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding to cDNAs comprising nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID No 2 at 5,
et les séquences qui en diffèrent par un ou plusieurs nucléotides. and the sequences which differ from it by one or more nucleotides.
3. Séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains correspondant à des ADNc correspondant à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments Vβ correspondant à l'une des séquences SEQ ID N° 2 à 5,  3. Nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors corresponding to cDNAs corresponding to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the Vβ segments corresponding to one of the sequences SEQ ID No. 2 to 5,
et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides. and sequences which differ by one or two nucleotides.
4. Séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes β des récepteurs des lymphocytes T humains correspondant à des ADNc correspondant à l'une des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments V/3 correspondant à l'une des séquences SEQ ID Nº 6 à 15, les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides et les fragments de celles-ci.  4. Nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors corresponding to cDNAs corresponding to one of the nucleotide sequences chosen from any of the V / 3 segments corresponding to one of the sequences SEQ ID Nº 6 to 15, the sequences which differ by one or two nucleotides and the fragments thereof.
5. Séquences nucléotidiques selon la revendication 4 dans laquelle les fragments des séquences correspondent à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments V β correspondant à l'une des séquences  5. Nucleotide sequences according to claim 4 in which the fragments of the sequences correspond to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the V β segments corresponding to one of the sequences
1 à 155 de SEQ ID N° 8  1 to 155 of SEQ ID N ° 8
l à 125 de SEQ ID N° 9  l to 125 of SEQ ID N ° 9
1 à 111 de SEQ ID N° 10  1 to 111 of SEQ ID N ° 10
et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides. and sequences which differ by one or two nucleotides.
6. Séquences nucléotidiques codant pour des régions variables de chaînes des récepteurs des lymphocytes T humain correspondant à des ADNc correspondant à tout ou partie des séquences nucléotidiques choisies parmi l'un quelconque des segments V/3 correspondant à l'une des séquences 6. Nucleotide sequences coding for regions human T cell receptor chain variables corresponding to cDNAs corresponding to all or part of the nucleotide sequences chosen from any one of the V / 3 segments corresponding to one of the sequences
l à 195 de SEQ ID N° 16  l to 195 of SEQ ID N ° 16
l à 99 de SEQ ID N° 17  l to 99 of SEQ ID N ° 17
1 à 113 de SEQ ID N° 18  1 to 113 of SEQ ID N ° 18
1 à 186 de SEQ ID N° 19  1 to 186 of SEQ ID N ° 19
et les séquences qui en diffèrent par un ou deux nucléotides.  and sequences which differ by one or two nucleotides.
7. Peptides codés par l'une quelconque des séquences nucléotidiques telles que définies à l'une quelconque des revendications 1 à 6, ainsi que les allèles et les dérivés de ceux-ci qui possèdent la même fonction.  7. Peptides encoded by any one of the nucleotide sequences as defined in any one of claims 1 to 6, as well as the alleles and derivatives thereof which have the same function.
8. Vecteurs d'expression comprenant une séquence d'ADN codant pour l'un des peptides tel que défini à la revendication 7.  8. Expression vectors comprising a DNA sequence coding for one of the peptides as defined in claim 7.
9. Hôtes transformés avec un vecteur selon la revendication 8.  9. Hosts transformed with a vector according to claim 8.
10. Anticorps dirigés contre un déterminant antigénique d'un des peptides définis à la revendication 7.  10. Antibodies directed against an antigenic determinant of one of the peptides defined in claim 7.
11. Anticorps selon la revendication 10 qui est un anticorps monoclonal ou un fragment de celui-ci.  11. The antibody of claim 10 which is a monoclonal antibody or a fragment thereof.
12. Fragment Fab, Fab1 ou F(ab')2 d'un anticorps monoclonal selon la revendication 11 et dérivés de celui-ci.  12. Fab, Fab1 or F (ab ') 2 fragment of a monoclonal antibody according to claim 11 and derivatives thereof.
13. Dérivés d'un anticorps monoclonal ou d'un fragment de celui-ci selon la revendication 11 ou  13. Derivatives of a monoclonal antibody or a fragment thereof according to claim 11 or
12 auxquels sont liés un marqueur détectable et/ou au moins une molécule thérapeutique.  12 to which are linked a detectable marker and / or at least one therapeutic molecule.
14. Hybridomes produisant un anticorps selon la revendication 11.  14. Antibody producing hybridomas according to claim 11.
15. Composition de diagnostic comprenant un ou plusieurs anticorps monoclonaux, fragments ou dérivés de ceux-ci tels que définis à l'une quelconque des revendications 11 à 13.  15. A diagnostic composition comprising one or more monoclonal antibodies, fragments or derivatives thereof as defined in any one of claims 11 to 13.
16. Composition thérapeutique comprenant un ou plusieurs anticorps monoclonaux, fragments ou dérivés de ceux-ci tels que définis à l'une des revendications 11 à 13.  16. Therapeutic composition comprising one or more monoclonal antibodies, fragments or derivatives thereof as defined in one of claims 11 to 13.
17. Composition selon la revendication 16 comprenant des dérivés contenant une molécule cytotoxique ou un radioisotope. 17. Composition according to claim 16 comprising derivatives containing a cytotoxic molecule or a radioisotope.
18. Composition thérapeutique comprenant au moins l'un des peptides définis à la revendication 7. 18. A therapeutic composition comprising at least one of the peptides defined in claim 7.
19. Composition thérapeutique comprenant des oligonucléo tides antisens correspondant à l'une quelconque des séquences d'un segment Vβ telles que définies à l'une quelconque des revendications 3 à 6.  19. Therapeutic composition comprising antisense oligonucleotides corresponding to any one of the sequences of a Vβ segment as defined in any one of claims 3 to 6.
20. Utilisation, en tant qu'amorces pour l'amplification d'ADN, de séquences nucléotidiques d'environ au moins 17 nucléotides comprises dans l'une quelconque des séquences d'u segment Vβ telles que définies à l'une quelconque des revendications 3 à 6.  20. Use, as primers for the amplification of DNA, of nucleotide sequences of approximately at least 17 nucleotides included in any one of the sequences of a Vβ segment as defined in any one of claims 3 to 6.
21. Utilisation, en tant que sonde de détection, de séquences nucléotidiques d'environ au moins 10 nucléotides comprises dans l'une quelconque des séquences d'un segment Vβ telles que définies à l'une quelconque des revendications 3 à 6.  21. Use, as a detection probe, of nucleotide sequences of approximately at least 10 nucleotides included in any one of the sequences of a Vβ segment as defined in any one of claims 3 to 6.
22. Oligonucléotides, utilisables comme amorces pour l'amplification d'ADN correspondant à des régions variables de chaînes β des récepteurs de cellules T, choisis parmi les séquences SEQ ID N° 25 à 48.  22. Oligonucleotides, usable as primers for the amplification of DNA corresponding to variable regions of β chains of T cell receptors, chosen from the sequences SEQ ID N ° 25 to 48.
23. Utilisation, comme amorces pour l'amplification d'ADN correspondant à des régions variables de chaînes des  23. Use, as primers for the amplification of DNA corresponding to variable regions of chain of
récepteurs des cellules T, d'oligonucléotides selon la T cell receptors, oligonucleotides according to the
revendication 22. claim 22.
24. Utilisation selon la revendication 23, d' oligonucléotides choisis parmi les séquences SEQ ID N° 45, 46, 47 et 48.  24. Use according to claim 23, of oligonucleotides chosen from the sequences SEQ ID No. 45, 46, 47 and 48.
25. Procédé de détection de séquences nucléotidiques codant pour des segments V/3 des récepteurs T ou d'ADNc correspondant aux produits de transcription de celles-ci, dans un échantillon biologique, caractérisé en ce qu'il comprend :  25. Method for detecting nucleotide sequences coding for V / 3 segments of T receptors or of cDNA corresponding to the transcription products thereof, in a biological sample, characterized in that it comprises:
a) l'amplification de l'ADN avec au moins une paire d'amorces formée par l'un des oligonucléotides selon la revendication 22 et un oligonucléotide appartenant au segment Cβ , et  a) amplification of the DNA with at least one pair of primers formed by one of the oligonucleotides according to claim 22 and an oligonucleotide belonging to the Cβ segment, and
b) la détection des séquences amplifiées avec une sonde Cβ .  b) the detection of the amplified sequences with a Cβ probe.
26. Procédé selon la revendication 25, caractérisé en ce que l'on effectue l'amplification en présence d'une paire d'amorces contrôle et la détection à l'aide d•une sonde contrôle. 26. The method of claim 25, characterized in that the amplification is carried out in the presence of a pair control primers and detection using a control probe.
27. Kit de diagnostic pour la mise en oeuvre d'un procédé selon la revendication 25, caractérisé en ce qu'il comprend : a) au moins un oligonucléotide selon la revendication 22,  27. Diagnostic kit for implementing a method according to claim 25, characterized in that it comprises: a) at least one oligonucleotide according to claim 22,
b) une amorce Cβ,  b) a Cβ primer,
c) une sonde Cβ .  c) a Cβ probe.
28. Kit de diagnostic pour la mise en oeuvre d'un procédé selon la revendication 26, caractérisé en ce qu'il comprend : a) au moins un oligonucléotide selon la revendication 22, b) une amorce Cβ ,  28. Diagnostic kit for implementing a method according to claim 26, characterized in that it comprises: a) at least one oligonucleotide according to claim 22, b) a Cβ primer,
c) une paire d'amorces contrôle,  c) a pair of control primers,
d) une sonde Cβ ,  d) a Cβ probe,
e) une sonde contrôle.  e) a control probe.
29. Kit selon la revendication 28 ou la revendication 29, comprenant :  29. Kit according to claim 28 or claim 29, comprising:
a) l'ensemble des 24 oligonucléotides selon la revendication 22,  a) all of the 24 oligonucleotides according to claim 22,
b) une amorce Cβ choisie parmi les séquences correspondant aux séquences SEQ ID 49 et 50,  b) a Cβ primer chosen from the sequences corresponding to sequences SEQ ID 49 and 50,
c) une paire d'amorces contrôle pour la β-actine ayant une séquence correspondant respectivement aux séquences SEQ ID N° 52 et 53,  c) a pair of control primers for β-actin having a sequence corresponding respectively to sequences SEQ ID No. 52 and 53,
d) une sonde Cβ correspondant à la séquence SEQ ID N° 51, e) une sonde contrôle pour la β-actine correspondant à la séquence SEQ ID N° 54.  d) a Cβ probe corresponding to the sequence SEQ ID No. 51, e) a control probe for β-actin corresponding to the sequence SEQ ID No. 54.
30. Hybridomes RO-73 et JU-74 produisant des anticorps monoclonaux anti V/313 déposés à la CNCM le 12 février 1992 sous les n°s I-1172 et I-1173.  30. RO-73 and JU-74 hybridomas producing anti-V / 313 monoclonal antibodies deposited at the CNCM on February 12, 1992 under the numbers I-1172 and I-1173.
31. Anticorps monoclonaux anti Vβ13 produit par les hybridomes selon la revendication 30.  31. Anti-Vβ13 monoclonal antibodies produced by the hybridomas according to claim 30.
EP92906703A 1991-02-12 1992-02-12 NUCLEOTIDIC SEQUENCES CODING FOR VARIABLE REGIONS OF $g(b) CHAINS OF HUMAN T LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDIC SEGMENTS AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS Withdrawn EP0528007A1 (en)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9101613 1991-02-12
FR9101613A FR2672617B1 (en) 1991-02-12 1991-02-12 NUCLEOTIDE SEQUENCES ENCODING VARIABLE REGIONS OF BETA CHAINS OF HUMAN T LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDE SEGMENTS AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS.
FR9104523A FR2675155A1 (en) 1991-04-12 1991-04-12 Nucleotide sequences encoding variable regions of beta chains of the receptors of human T lymphocytes, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic applications
FR9104523 1991-04-12

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EP0528007A1 true EP0528007A1 (en) 1993-02-24

Family

ID=26228507

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EP92906703A Withdrawn EP0528007A1 (en) 1991-02-12 1992-02-12 NUCLEOTIDIC SEQUENCES CODING FOR VARIABLE REGIONS OF $g(b) CHAINS OF HUMAN T LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDIC SEGMENTS AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS

Country Status (8)

Country Link
US (3) US5700907A (en)
EP (1) EP0528007A1 (en)
JP (1) JPH06502997A (en)
KR (2) KR100227303B1 (en)
AU (1) AU660306B2 (en)
CA (1) CA2079881C (en)
IE (1) IE920447A1 (en)
WO (1) WO1992013950A2 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5409631A (en) * 1990-03-22 1995-04-25 Ultradent Products Dental bleaching compositions and methods for bleaching teeth surfaces

Families Citing this family (44)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5776459A (en) * 1989-07-19 1998-07-07 Connetics Corporation TCR V beta 5 peptides
US7294712B2 (en) * 1990-06-04 2007-11-13 Aventis Pharma S.A. Nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic uses
IE920447A1 (en) * 1991-02-12 1992-08-12 Roussel Uclaf NUCLEOTIDE SEQUENCES CODING FOR ß-CHAIN VARIABLE REGIONS OF¹HUMAN T-LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDE SEGMENTS¹AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS
US5552300A (en) * 1994-01-13 1996-09-03 T Cell Sciences, Inc. T cell antigen receptor V region proteins and methods of preparation thereof
FR2736831B1 (en) * 1995-07-19 1997-08-22 Centre Nat Rech Scient NUCLEOTIDE AND PEPTIDE SEQUENCES FOR THE TREATMENT OF MYASTHENIA
US6087096A (en) * 1995-11-13 2000-07-11 Dau; Peter C. Method of intrafamily fragment analysis of the T cell receptor α and β chain CDR3 regions
AU1744500A (en) * 1998-11-25 2000-06-13 University Of Cincinnati, The Polymorphisms in the 5' leader cistron of the beta2-adrenergic receptor
US6861217B1 (en) 1998-11-25 2005-03-01 Genaissance Pharmaceuticals, Inc. Variation in drug response related to polymorphisms in the β2-adrenergic receptor
CA2490903A1 (en) * 2002-07-03 2004-01-15 Institute For Scientific Research, Inc. Compositions and methods for the detection of human t cell receptor variable family gene expression
US7375211B2 (en) * 2005-11-18 2008-05-20 Kou Zhong C Method for detection and quantification of T-cell receptor Vβ repertoire
EP2044949A1 (en) 2007-10-05 2009-04-08 Immutep Use of recombinant lag-3 or the derivatives thereof for eliciting monocyte immune response
US9528160B2 (en) 2008-11-07 2016-12-27 Adaptive Biotechnolgies Corp. Rare clonotypes and uses thereof
US8748103B2 (en) 2008-11-07 2014-06-10 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
US9506119B2 (en) 2008-11-07 2016-11-29 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of sequence determination using sequence tags
US8628927B2 (en) 2008-11-07 2014-01-14 Sequenta, Inc. Monitoring health and disease status using clonotype profiles
JP5798926B2 (en) 2008-11-07 2015-10-21 シーケンタ インコーポレイテッド How to monitor disease states by sequence analysis
US9365901B2 (en) 2008-11-07 2016-06-14 Adaptive Biotechnologies Corp. Monitoring immunoglobulin heavy chain evolution in B-cell acute lymphoblastic leukemia
EP2387627B1 (en) 2009-01-15 2016-03-30 Adaptive Biotechnologies Corporation Adaptive immunity profiling and methods for generation of monoclonal antibodies
CA2765949C (en) 2009-06-25 2016-03-29 Fred Hutchinson Cancer Research Center Method of measuring adaptive immunity
US10385475B2 (en) 2011-09-12 2019-08-20 Adaptive Biotechnologies Corp. Random array sequencing of low-complexity libraries
CA2853088C (en) 2011-10-21 2018-03-13 Adaptive Biotechnologies Corporation Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells
EP3904536A1 (en) 2011-12-09 2021-11-03 Adaptive Biotechnologies Corporation Diagnosis of lymphoid malignancies and minimal residual disease detection
US9499865B2 (en) 2011-12-13 2016-11-22 Adaptive Biotechnologies Corp. Detection and measurement of tissue-infiltrating lymphocytes
EP3372694A1 (en) 2012-03-05 2018-09-12 Adaptive Biotechnologies Corporation Determining paired immune receptor chains from frequency matched subunits
CN107586832B (en) 2012-05-08 2021-03-30 适应生物技术公司 Compositions and methods for measuring and calibrating amplification bias in multiplex PCR reactions
ES2660027T3 (en) 2012-10-01 2018-03-20 Adaptive Biotechnologies Corporation Evaluation of immunocompetence by the diversity of adaptive immunity receptors and clonal characterization
US10119134B2 (en) 2013-03-15 2018-11-06 Abvitro Llc Single cell bar-coding for antibody discovery
US9708657B2 (en) 2013-07-01 2017-07-18 Adaptive Biotechnologies Corp. Method for generating clonotype profiles using sequence tags
GB201322626D0 (en) 2013-12-19 2014-02-05 Immutep S A Combined preparations for the treatment of cancer
JOP20200094A1 (en) 2014-01-24 2017-06-16 Dana Farber Cancer Inst Inc Antibody molecules to pd-1 and uses thereof
US20170292149A1 (en) 2014-03-05 2017-10-12 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods using randomer-containing synthetic molecules
KR20220126813A (en) 2014-03-14 2022-09-16 노파르티스 아게 Antibody molecules to lag-3 and uses thereof
US11390921B2 (en) 2014-04-01 2022-07-19 Adaptive Biotechnologies Corporation Determining WT-1 specific T cells and WT-1 specific T cell receptors (TCRs)
US10066265B2 (en) 2014-04-01 2018-09-04 Adaptive Biotechnologies Corp. Determining antigen-specific t-cells
ES2777529T3 (en) 2014-04-17 2020-08-05 Adaptive Biotechnologies Corp Quantification of adaptive immune cell genomes in a complex mixture of cells
ES2727656T3 (en) 2014-09-15 2019-10-17 Abvitro Llc High performance sequencing of nucleotide banks
EP3212790B1 (en) 2014-10-29 2020-03-25 Adaptive Biotechnologies Corp. Highly-multiplexed simultaneous detection of nucleic acids encoding paired adaptive immune receptor heterodimers from many samples
US10246701B2 (en) 2014-11-14 2019-04-02 Adaptive Biotechnologies Corp. Multiplexed digital quantitation of rearranged lymphoid receptors in a complex mixture
US11066705B2 (en) 2014-11-25 2021-07-20 Adaptive Biotechnologies Corporation Characterization of adaptive immune response to vaccination or infection using immune repertoire sequencing
GB201500374D0 (en) 2015-01-09 2015-02-25 Immutep S A Combined preparations for the treatment of cancer
AU2016222788B2 (en) 2015-02-24 2022-03-31 Adaptive Biotechnologies Corp. Methods for diagnosing infectious disease and determining HLA status using immune repertoire sequencing
EP3277294A4 (en) 2015-04-01 2018-11-14 Adaptive Biotechnologies Corp. Method of identifying human compatible t cell receptors specific for an antigenic target
US10428325B1 (en) 2016-09-21 2019-10-01 Adaptive Biotechnologies Corporation Identification of antigen-specific B cell receptors
US11254980B1 (en) 2017-11-29 2022-02-22 Adaptive Biotechnologies Corporation Methods of profiling targeted polynucleotides while mitigating sequencing depth requirements

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3588219T2 (en) 1984-03-01 2000-05-18 Univ Leland Stanford Junior T cell receptor, specific for antigen polypeptides and related polynucleotides
US4786590A (en) * 1985-01-15 1988-11-22 California Institute Of Technology Diagnostic and therapeutic aspects of receptor-mediated leukemogenesis
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
US4886743A (en) * 1985-04-24 1989-12-12 California Institute Of Technology Diagnostic reagents based on unique sequences within the variable region of the T cell receptor and uses thereof
US4743679A (en) 1986-02-24 1988-05-10 Creative Biomolecules, Inc. Process for producing human epidermal growth factor and analogs thereof
US6194561B1 (en) 1986-03-13 2001-02-27 Roche Molecular Systems, Inc. Characterization and detection of sequences associated with autoimmune diseases
US4892827A (en) * 1986-09-24 1990-01-09 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Recombinant pseudomonas exotoxins: construction of an active immunotoxin with low side effects
JPH02441A (en) * 1986-11-19 1990-01-05 Mitsui Toatsu Chem Inc Gene complex and diagnosis using the same complex
US5447839A (en) 1988-09-09 1995-09-05 Hoffmann-La Roche Inc. Detection of human papillomavirus by the polymerase chain reaction
JP2781438B2 (en) * 1988-10-20 1998-07-30 モーリィ，アリグザンダー，アラン Diagnostic method of monoclonality in leukemia and lymphoma
US5223426A (en) * 1988-12-15 1993-06-29 T Cell Sciences, Inc. Monoclonal antibodies reactive with defined regions of the t-cell antigen receptor
US5043272A (en) 1989-04-27 1991-08-27 Life Technologies, Incorporated Amplification of nucleic acid sequences using oligonucleotides of random sequence as primers
IE920413A1 (en) 1991-02-08 1992-08-12 Roussel Uclaf Nucleotide sequence coding for ó-chain variable regions of¹human t-lymphocyte receptors, corresponding peptide segments¹and diagnostic and therapeutic applications
IE920447A1 (en) * 1991-02-12 1992-08-12 Roussel Uclaf NUCLEOTIDE SEQUENCES CODING FOR ß-CHAIN VARIABLE REGIONS OF¹HUMAN T-LYMPHOCYTE RECEPTORS, CORRESPONDING PEPTIDE SEGMENTS¹AND DIAGNOSTIC AND THERAPEUTIC APPLICATIONS
US6084087A (en) 1991-09-27 2000-07-04 New York Society For The Ruptured And Crippled Maintaing The Hospital For Special Surgery DNA encoding conserved T-cell receptor sequences

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
See references of WO9213950A2 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5409631A (en) * 1990-03-22 1995-04-25 Ultradent Products Dental bleaching compositions and methods for bleaching teeth surfaces

Also Published As

Publication number Publication date
AU660306B2 (en) 1995-06-22
KR100227303B1 (en) 1999-12-01
US5700907A (en) 1997-12-23
US20080069770A1 (en) 2008-03-20
US5830758A (en) 1998-11-03
WO1992013950A2 (en) 1992-08-20
KR930700658A (en) 1993-03-15
JPH06502997A (en) 1994-04-07
IE920447A1 (en) 1992-08-12
AU1544592A (en) 1992-09-07
CA2079881A1 (en) 1992-08-13
WO1992013950A3 (en) 1993-02-04
CA2079881C (en) 2007-11-06
US8709426B2 (en) 2014-04-29
KR100297082B1 (en) 2001-09-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CA2079881C (en) Nucleotidic sequences coding for variable regions of .beta. chains of human t lymphocite receptors, corresponding peptidic segments and diagnostic and therapeutic applications
EP0529033B1 (en) Nucleotide sequences coding for alpha chain variable regions in human lymphocyte receptors and applications thereof
WO2000058480A1 (en) Novel cytidine deaminase
JPH05310596A (en) Immunosuppressant containing antibody
CA2034593A1 (en) Recombinant human anti-cd18 antibodies
JPH08501925A (en) Monoclonal antibody against glycoprotein P
JP2004529624A (en) T cell receptor variants expressed in mesenchymal cells and uses thereof
US7294712B2 (en) Nucleotide sequences coding for variable regions of β chains of human T lymphocyte receptors, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic uses
EP0499555B1 (en) Recombinant DNA coding for a T-cell receptor chain, process for preparation and antibodies and pharmaceutical compositions comprising the same
FR2675155A1 (en) Nucleotide sequences encoding variable regions of beta chains of the receptors of human T lymphocytes, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic applications
FR2672617A1 (en) Nucleotide sequences encoding variable regions of beta chains of the receptors of human T lymphocytes, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic applications
FR2672616A1 (en) Nucleotide sequences encoding variable regions of alpha chains of the receptors of human T lymphocytes, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic applications
FR2675156A1 (en) Nucleotide sequences encoding variable regions of alpha chains of the receptors of human T lymphocytes, corresponding peptide segments and the diagnostic and therapeutic applications
EP0524899A1 (en) Recombinant DNA molecules coding for the VB2 T cell receptor, method of preparation, antibodies and medicaments containing them
EP0534878A1 (en) Recombinant DNA molecules containing the coding part of a VBeta17 chain of the T cell antigen receptor and uses thereof
JPH09100300A (en) Amino acid sequence of anticancer human monoclonal antibody and dna base sequence coding for the same
CN117924478A (en) Chimeric antibodies and methods of production for treating amyloid deposition disease
JPH0928385A (en) Dna arrangement of cd23 under soluble state and its application
WO2003014163A1 (en) Anti-idiotypic antibodies of hla class i molecules and the use thereof in the preparation of compositions that are designed to inhibit vascular activation

Legal Events

Date Code Title Description
PUAI Public reference made under article 153(3) epc to a published international application that has entered the european phase

Free format text: ORIGINAL CODE: 0009012

17P Request for examination filed

Effective date: 19921104

AK Designated contracting states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AT BE CH DE DK ES FR GB GR IT LI LU MC NL SE

RAP1 Party data changed (applicant data changed or rights of an application transferred)

Owner name: ROUSSEL UCLAF

17Q First examination report despatched

Effective date: 19970930

RAP1 Party data changed (applicant data changed or rights of an application transferred)

Owner name: HOECHST MARION ROUSSEL

RAP1 Party data changed (applicant data changed or rights of an application transferred)

Owner name: AVENTIS PHARMA S.A.

STAA Information on the status of an ep patent application or granted ep patent

Free format text: STATUS: THE APPLICATION IS DEEMED TO BE WITHDRAWN

18D Application deemed to be withdrawn

Effective date: 20010428